Variación de la patogenicidad de Fusarium oxysporum f.sp. dianthi en relación con la resistencia o susceptibilidad de híbridos de clavel (Dianthus caryophyllus)

Fusarium oxysporum (FOX) es un complejo de especies, mundialmente reconocido por su agresividad y capacidad de afectar varias especies vegetales. FOX es el causante de la marchitez vascular, una enfermedad que en la actualidad se considera un factor de impacto en el sector agrícola debido a las gran...

Full description

Autores:
Hernández Rodríguez, Aura Vanessa
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2023
Institución:
Universidad Militar Nueva Granada
Repositorio:
Repositorio UMNG
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.unimilitar.edu.co:10654/45962
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/10654/45962
Palabra clave:
Fusarium oxysporum
Pathogenicity
Genetic Variability
FUSARIUM OXYSPORUM
DIANTHUS CARYOPHYLLUS
Fusarium oxysporum
Patogenicidad
Variabilidad Genética
Rights
openAccess
License
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description Fusarium oxysporum (FOX) es un complejo de especies, mundialmente reconocido por su agresividad y capacidad de afectar varias especies vegetales. FOX es el causante de la marchitez vascular, una enfermedad que en la actualidad se considera un factor de impacto en el sector agrícola debido a las grandes pérdidas económicas que genera. Las características más destacadas de este complejo de especies de FOX son: la alta variabilidad genética y la similitud morfológica. Debido a lo anterior, hay dificultades tanto en su taxonomía como en el manejo de la enfermedad, por lo que se propuso considerar diferencias fisiológicas con base en la patogenicidad del parásito, como caracteres para su clasificación y manejo. Este trabajo tiene como finalidad determinar variaciones en la patogenicidad de distintos aislados de Fusarium oxysporum en variedades híbridas de clavel e identificar polimorfismo en genes asociados a patogenicidad. Para ello, se evaluó la patogenicidad de cinco aislados distintos sobre variedades híbridas de clavel; dos resistentes y dos susceptibles en condiciones controladas in vitro y ex vitro. Para evaluar variaciones en genes asociados a la patogenicidad, se realizó extracción de ADN de los aislados de FOX y posteriormente se hizo amplificación por PCR de un grupo de genes ortólogos y genes reportados para patogenicidad, de los cuales se obtuvo secuencias. A partir de ellas, se determinó polimorfismo entre los aislados, variaciones en la patogenicidad y diferencias en la respuesta de resistencia de variedades resistentes y susceptibles de clavel.
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spelling Filgueira Duarte, Juan JoséHernández Rodríguez, Aura VanessaBiólogo2024-05-02T14:44:16Z2024-05-02T14:44:16Z2023-08-01http://hdl.handle.net/10654/45962instname:Universidad Militar Nueva Granadareponame:Repositorio Institucional Universidad Militar Nueva Granadarepourl:https://repository.unimilitar.edu.coFusarium oxysporum (FOX) es un complejo de especies, mundialmente reconocido por su agresividad y capacidad de afectar varias especies vegetales. FOX es el causante de la marchitez vascular, una enfermedad que en la actualidad se considera un factor de impacto en el sector agrícola debido a las grandes pérdidas económicas que genera. Las características más destacadas de este complejo de especies de FOX son: la alta variabilidad genética y la similitud morfológica. Debido a lo anterior, hay dificultades tanto en su taxonomía como en el manejo de la enfermedad, por lo que se propuso considerar diferencias fisiológicas con base en la patogenicidad del parásito, como caracteres para su clasificación y manejo. Este trabajo tiene como finalidad determinar variaciones en la patogenicidad de distintos aislados de Fusarium oxysporum en variedades híbridas de clavel e identificar polimorfismo en genes asociados a patogenicidad. Para ello, se evaluó la patogenicidad de cinco aislados distintos sobre variedades híbridas de clavel; dos resistentes y dos susceptibles en condiciones controladas in vitro y ex vitro. Para evaluar variaciones en genes asociados a la patogenicidad, se realizó extracción de ADN de los aislados de FOX y posteriormente se hizo amplificación por PCR de un grupo de genes ortólogos y genes reportados para patogenicidad, de los cuales se obtuvo secuencias. A partir de ellas, se determinó polimorfismo entre los aislados, variaciones en la patogenicidad y diferencias en la respuesta de resistencia de variedades resistentes y susceptibles de clavel.ÍNDICE DE FIGURAS 7 ÍNDICE DE TABLAS 8 ÍNDICE DE ANEXOS 9 1. CAPÍTULO I: Variabilidad genética de Fusarium oxysporum y su relación con la patogenicidad 10 1.1. Fusarium oxysporum características y su impacto 10 1.2. Ciclo de vida de F. oxysporum 11 1.3. El clavel (Dianthus caryophyllus) y el impacto de Fusarium oxysporum 12 1.4. Patogenicidad y Virulencia de F. oxysporum 13 1.5. Variabilidad genética de Fusarium oxysporum 14 1.6. Estado de las Formas especiales de Fusarium oxysporum 16 1.7. Biotecnología y los mecanismos de control de Fusarium oxysporum 16 2. CAPÍTULO 2: Variación de la patogenicidad de Fusarium oxysporum f.sp. dianthi en relación con la resistencia o susceptibilidad de híbridos de Dianthus caryophyllus. 18 2.1. RESUMEN 18 2.2. ABSTRACT 18 2.3. INTRODUCCIÓN 19 2.4. OBJETIVOS 21 2.4.1. General 21 2.4.2. Objetivos Específicos 21 2.5. MATERIALES Y MÉTODOS 21 2.5.1. Área de estudio 21 2.5.2. Obtención del Material Biológico 21 2.5.2.1. Obtención y propagación de los aislados de Fusarium oxysporum 21 2.5.2.2. Obtención de cultivos monospóricos y propagación de los aislados de Fusarium oxysporum 22 2.5.2.3. Propagación de material vegetal in vitro 22 2.5.3. Ensayos de patogenicidad in vitro 24 2.5.3.1. Evaluación de síntomas del hospedero y determinación de la incidencia y severidad ensayo in vitro 24 2.5.3.2. Análisis estadístico en ensayos de patogenicidad in vitro 25 2.5.4. Ensayos de patogenicidad ex vitro 25 2.5.4.1. Seguimiento de síntomas del hospedero y determinación del progreso de la enfermedad en ensayo ex vitro 26 2.5.4.2. Análisis estadístico y AUDPC en ensayos de patogenicidad ex vitro 26 2.5.5. Caracterización molecular 27 2.5.5.1. Extracción de ADN 27 2.5.5.2. Evaluación por PCR de genes representativos del genoma y genes SIX 27 6 2.6. RESULTADOS 30 2.6.1. Caracterización morfológica de Fusarium oxysporum 30 2.6.2. Ensayo de patogenicidad in vitro de los cinco aislados de FOX sobre las variedades resistentes y susceptibles de clavel 31 2.6.3. Evaluación de la infección de FOX en las plantas por indexación 37 2.6.3.1. Incidencia y severidad para el ensayo in vitro y la respuesta de las variedades resistentes y susceptibles de clavel a la presencia de FOX. 40 2.6.3.2. Análisis estadístico de los valores de incidencia y severidad para el ensayo in vitro 44 2.6.4. Ensayos de patogenicidad, sintomatología de marchitez vascular y seguimiento de los síntomas ex vitro. 47 2.6.5. Incidencia y severidad para el ensayo ex vitro y la respuesta de las variedades resistentes y susceptibles de clavel a la presencia de FOX. 50 2.6.5.1. Análisis estadístico de los valores de Incidencia y Severidad para el ensayo ex vitro 51 2.6.6. Caracterización molecular 53 2.6.6.1. Extracción de ADN Fúngico 53 2.6.6.2. Amplificación por Reacción en Cadena de la Polimerasa para genes ortólogos y genes SIX. 54 2.6.6.3. PCR con los primers H4a/H4b, ITS1/ITS2/ITS4 54 2.6.6.4. PCR con los primers SIX 56 2.7. DISCUSIÓN 57 2.7.1. Evaluación de síntomas en las variedades resistentes y susceptibles de clavel frente a la infección ocasionada por los cinco aislados de FOX 57 2.7.2. Diferencias en las respuesta de resistencia a la infección ocasionada por distintos aislados de FOX en variedades resistentes y susceptibles de clavel 58 2.7.3. Variaciones en la patogenicidad de aislados de FOX sobre variedades resistentes y susceptibles de clavel 59 2.7.4. Diferencias en la resistencia entre variedades resistentes y susceptibles a distintos aislados 60 2.7.5. Respuesta de resistencia en ensayos ex vitro 60 2.7.6. Importancia de cultivares resistentes 61 2.7.7. Evaluación de los genes SIX en los cinco aislados de FOX. 62 2.8. CONCLUSIONES 64 2.9. RECOMENDACIONES 65 2.10. BIBLIOGRAFÍA 65 ANEXOSFusarium oxysporum (FOX) is a species complex, worldwide recognized for its aggressiveness and ability to affect several plant species. FOX is the cause of vascular wilt, a disease that is currently considered an impact factor in the agricultural sector due to the large economic losses it generates, affecting several plant species. The most outstanding characteristics of this complex of FOX species are: high genetic variability and morphological similarity. Due to the above, there are difficulties both in their taxonomy and in the management of the disease, so it was proposed to consider physiological differences based on the pathogenicity of the parasite, as characters for its classification and management. This work aims to determine variations in the pathogenicity of different isolates of Fusarium oxysporum in hybrid varieties of carnation and to identify polymorphism in genes associated with pathogenicity. For this purpose, the pathogenicity of five different isolates of FOX on hybrid carnation varieties was evaluated; two resistant and two susceptible under controlled in vitro and ex vitro conditions. To evaluate variations in genes associated with pathogenicity, DNA was extracted from FOX isolates and then PCR amplification was performed on a group of orthologous genes and genes reported for pathogenicity, from which sequences were obtained. From these sequences. Polymorphism among isolates, variations in pathogenicity and differences in the resistance response of resistant and susceptible carnation varieties were determined.Pregradoapplicaction/pdfspahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 InternationalAcceso abiertohttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Variación de la patogenicidad de Fusarium oxysporum f.sp. dianthi en relación con la resistencia o susceptibilidad de híbridos de clavel (Dianthus caryophyllus)Pathogenicity variation of Fusarium oxysporum f.sp. dianthi in relation to resistance or susceptibility of carnation (Dianthus caryophyllus) hybridsTesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fFusarium oxysporumPathogenicityGenetic VariabilityFUSARIUM OXYSPORUMDIANTHUS CARYOPHYLLUSFusarium oxysporumPatogenicidadVariabilidad GenéticaBiología AplicadaFacultad de Ciencias BásicasUniversidad Militar Nueva Granada1. 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