Descubrimiento analítico de la microbiota intestinal

El proyecto se realiza en colaboración con el profesor Alejandro Reyes del departamento de Biología de la Universidad de los Andes. Con el objetivo de resolver el problema de la caracterización y análisis de datos de la microbiota intestinal en individuos colombianos, se desarrolla la librería anbio...

Full description

Autores:
Pardo Ruiz, Juan Sebastián
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2025
Institución:
Universidad de los Andes
Repositorio:
Séneca: repositorio Uniandes
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.uniandes.edu.co:1992/76274
Acceso en línea:
https://hdl.handle.net/1992/76274
Palabra clave:
Microbiota Intestinal
Analítica de Datos
Ingeniería
Rights
openAccess
License
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description El proyecto se realiza en colaboración con el profesor Alejandro Reyes del departamento de Biología de la Universidad de los Andes. Con el objetivo de resolver el problema de la caracterización y análisis de datos de la microbiota intestinal en individuos colombianos, se desarrolla la librería anbiopy en Python que permite analizar datos de microbiota teniendo en cuenta variables demográficas, alimenticias y antropométricas. Las funcionalidades implementadas ofrecen herramientas para obtener métricas particulares al análisis biológico, graficar relaciones entre variables, identificar posibles predictores de una variable objetivo en múltiples niveles taxonómicos y hacer pruebas estadísticas entre variables. Todas estas funcionalidades fueron validadas antes y después de implementar, logrando así, una librería que fuese útil desde la perspectiva de un microbiólogo. El link del paquete en PyPi es el siguiente: https://pypi.org/project/anbiopy/
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Las funcionalidades implementadas ofrecen herramientas para obtener métricas particulares al análisis biológico, graficar relaciones entre variables, identificar posibles predictores de una variable objetivo en múltiples niveles taxonómicos y hacer pruebas estadísticas entre variables. Todas estas funcionalidades fueron validadas antes y después de implementar, logrando así, una librería que fuese útil desde la perspectiva de un microbiólogo. El link del paquete en PyPi es el siguiente: https://pypi.org/project/anbiopy/Pregrado27 páginasapplication/pdfspaUniversidad de los AndesIngeniería de Sistemas y ComputaciónFacultad de IngenieríaDepartamento de Ingeniería de Sistemas y ComputaciónAttribution 4.0 Internationalhttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Descubrimiento analítico de la microbiota intestinalTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TPMicrobiota IntestinalAnalítica de DatosIngenieríaDe La Cuesta-Zuluaga, J., Corrales-Agudelo, V., Carmona, J. A., Abad, J. M., & Escobar, J. S. (2018). Body size phenotypes comprehensively assess cardiometabolic risk and refine the association between obesity and gut microbiota. International Journal of Obesity, 42(3), 424- 432.García-Vega, Á. S., Corrales-Agudelo, V., Reyes, A., & Escobar, J. S. (2020). Diet quality, food groups and nutrients associated with the gut microbiota in a nonwestern population. Nutrients, 12(10), 2938.Guzmán-Castañeda, S. J., Ortega-Vega, E. L., de la Cuesta-Zuluaga, J., Velásquez-Mejía, E. P., Rojas, W., Bedoya, G., & Escobar, J. S. (2020). Gut microbiota composition explains more variance in the host cardiometabolic risk than genetic ancestry. Gut Microbes, 11(2), 191-204De la Cuesta-Zuluaga, J., Mueller, N. T., Álvarez-Quintero, R., Velásquez-Mejía, E. P., Sierra, J. A., Corrales-Agudelo, V., ... & Escobar, J. S. (2018). Higher fecal short-chain fatty acid levels are associated with gut microbiome dysbiosis, obesity, hypertension and cardiometabolic disease risk factors. Nutrients, 11(1), 51De la Cuesta-Zuluaga, J., Corrales-Agudelo, V., Velásquez-Mejía, E. P., Carmona, J. A., Abad, J. M., & Escobar, J. S. (2018). 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