Predicción de péptidos de unión a células eritrocíticas usando herramientas computacionales

En la Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC) existe una estrategia para el diseño de vacunas sintéticas. Ésta se basa en la identificación de fragmentos peptídicos de más o menos 20 aminoácidos provenientes de las proteínas involucradas en la invasión de diferentes patógenos a sus re...

Full description

Autores:
Martínez Rey, Cristian Johanny
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2012
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
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Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/21154
http://bdigital.unal.edu.co/11905/
Palabra clave:
0 Generalidades / Computer science, information and general works
61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health
62 Ingeniería y operaciones afines / Engineering
Péptidos
HABP
Vacunas sintéticas
Herramientas computacionales
Simuladores
Inteligencia artificial
Comportamientos emergentes
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Artificial intelligence
Emergent behaviors
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description En la Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC) existe una estrategia para el diseño de vacunas sintéticas. Ésta se basa en la identificación de fragmentos peptídicos de más o menos 20 aminoácidos provenientes de las proteínas involucradas en la invasión de diferentes patógenos a sus respectivas células objetivo (hospederas). Se quiere, para una proteína dada, identificar los fragmentos que tengan una alta capacidad de unión específica (del inglés High Activity Binding Peptides, HABP) a células eritrocíticas, sin tener que examinarlos experimentalmente, exclusivamente en cortes de 20 aminoácidos, para de esta manera poder recorrer cada elemento de la cadena como punto de partida para su predicción. Se emplean diferentes herramientas computacionales para intentar predecir los HABP y se utiliza una peptidoteca revisada del resultado experimental de 63 proteínas y un pseudogén, la cual contiene 2483 péptidos debidamente clasificados como HABP o no HABP. Los resultados no permiten aún predecir con precisión un HABP, pero sirven de acercamiento para seguir explorando alternativas computacionales que permitan reducir los tiempos y los costos de las fases experimentales en la elaboración de vacunas sintéticas.
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