A sparse representation of the pathologist's interaction with Whole Slide Images in order to improve the captured relevance in regions of interest

Durante una tarea de diagn´ostico, un pat´ologo corre sobre un WSI (”Whole Slide Image”), con el objetivo de descubrir patrones patol´ogicos relevantes. Un microscopio virtual capta estas estructuras pero tambi´en otros patrones celulares con diferentes o ning´un significado diagn´ostico. La anotaci´on de estas im´agenes depende entonces de la delineaci´on manual, una tarea dif´ıcil en la pr´actica. Este art´ıculo presenta un nuevo m´etodo para detectar regiones relevantes en WSI utilizando las navegaciones de rutina en un microscopio virtual. El m´etodo construye una representaci´on escasa o un diccionario de cada trayecto de navegaci´on y determina la relevancia oculta maximizando la incoherencia entre varios trayectos. Los diccionarios obtenidos se proyectan entre s´ı y la informaci´on relevante se establece en los ´atomos del diccionario cuya similitud es superior a un umbral personalizado. La evaluaci´on se realiz´o con 6 imagenes patologicas con n´ucleos segmentados a partir de una biopsia cut´anea diagnosticada con carcinoma basocelular (BCC). Los resultados muestran que nuestro enfoque supera a la l´ınea base en m´as de 20 %

• Autores: Santiago Garnica, Daniel Ernesto
• Fecha de publicación: 2017
• Institución: Universidad Nacional de Colombia
• Repositorio: Universidad Nacional de Colombia
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.unal.edu.co:unal/63208
• Acceso en línea: https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/63208; http://bdigital.unal.edu.co/63414/
• Palabra clave: 6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology; 61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health; Digital Pathilogy; Skin cancer; Nuclei segmentation; Relevant regions; Pathological patterns; Cáncer de piel; Segmentación de núcleos; Regiones relevantes; Patrones patológicos
• Rights: openAccess
• License: Atribución-NoComercial 4.0 Internacional