A sparse representation of the pathologist's interaction with Whole Slide Images in order to improve the captured relevance in regions of interest

Durante una tarea de diagn´ostico, un pat´ologo corre sobre un WSI (”Whole Slide Image”), con el objetivo de descubrir patrones patol´ogicos relevantes. Un microscopio virtual capta estas estructuras pero tambi´en otros patrones celulares con diferentes o ning´un significado diagn´ostico. La anotaci...

Full description

Autores:: Santiago Garnica, Daniel Ernesto

Tipo de recurso:

Fecha de publicación:: 2017

Institución:: Universidad Nacional de Colombia

Repositorio:: Universidad Nacional de Colombia

Idioma:: spa

Description
Summary:	Durante una tarea de diagn´ostico, un pat´ologo corre sobre un WSI (”Whole Slide Image”), con el objetivo de descubrir patrones patol´ogicos relevantes. Un microscopio virtual capta estas estructuras pero tambi´en otros patrones celulares con diferentes o ning´un significado diagn´ostico. La anotaci´on de estas im´agenes depende entonces de la delineaci´on manual, una tarea dif´ıcil en la pr´actica. Este art´ıculo presenta un nuevo m´etodo para detectar regiones relevantes en WSI utilizando las navegaciones de rutina en un microscopio virtual. El m´etodo construye una representaci´on escasa o un diccionario de cada trayecto de navegaci´on y determina la relevancia oculta maximizando la incoherencia entre varios trayectos. Los diccionarios obtenidos se proyectan entre s´ı y la informaci´on relevante se establece en los ´atomos del diccionario cuya similitud es superior a un umbral personalizado. La evaluaci´on se realiz´o con 6 imagenes patologicas con n´ucleos segmentados a partir de una biopsia cut´anea diagnosticada con carcinoma basocelular (BCC). Los resultados muestran que nuestro enfoque supera a la l´ınea base en m´as de 20 %

A sparse representation of the pathologist's interaction with Whole Slide Images in order to improve the captured relevance in regions of interest

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