Frecuencias alélicas, genotípicas y haplotípicas HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 en donantes fallecidos, Medellín, Colombia
RESUMEN: Introducción. La caracterización genética del sistema HLA es de gran utilidad en estudios antropogenéticos, en la comprensión de mecanismos asociados a susceptibilidad o resistencia a diversas enfermedades, en los fenómenos inmunológicos durante el embarazo y en la selección de donantes/rec...
- Autores:
-
Rodríguez Padilla, Libia María
Giraldo Jiménez, Mabel Cristina
García González, Natalia
Velásquez Castrillón, Laura Isabel
París Ángel, Sara Claudia
Álvarez Botero, Cristiam Mauricio
García Moreno, Luis Fernando
- Tipo de recurso:
- Article of investigation
- Fecha de publicación:
- 2007
- Institución:
- Universidad de Antioquia
- Repositorio:
- Repositorio UdeA
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/38066
- Acceso en línea:
- https://hdl.handle.net/10495/38066
- Palabra clave:
- Frecuencia de los Genes
Gene Frequency
Predisposición Genética a la Enfermedad
Genetic Predisposition to Disease
Antígenos HLA-A
HLA-A Antigens
Antígenos HLA-B
HLA-B Antigens
Antígenos HLA-DR
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Cadenas HLA-DRB1
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Haplotipos
Haplotypes
Genotipo
Genotype
Prueba de Histocompatibilidad
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Frecuencias alélicas, genotípicas y haplotípicas HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 en donantes fallecidos, Medellín, Colombia Frecuencia de los Genes Gene Frequency Predisposición Genética a la Enfermedad Genetic Predisposition to Disease Antígenos HLA-A HLA-A Antigens Antígenos HLA-B HLA-B Antigens Antígenos HLA-DR HLA-DR Antigens Cadenas HLA-DRB1 HLA-DRB1 Chains Haplotipos Haplotypes Genotipo Genotype Prueba de Histocompatibilidad Histocompatibility Testing https://id.nlm.nih.gov/mesh/D005787 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D020022 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D015234 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D015235 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D006684 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D059811 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D006239 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D005838 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D006650 |
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Frecuencia de los Genes Gene Frequency Predisposición Genética a la Enfermedad Genetic Predisposition to Disease Antígenos HLA-A HLA-A Antigens Antígenos HLA-B HLA-B Antigens Antígenos HLA-DR HLA-DR Antigens Cadenas HLA-DRB1 HLA-DRB1 Chains Haplotipos Haplotypes Genotipo Genotype Prueba de Histocompatibilidad Histocompatibility Testing https://id.nlm.nih.gov/mesh/D005787 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D020022 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D015234 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D015235 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D006684 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D059811 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D006239 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D005838 https://id.nlm.nih.gov/mesh/D006650 |
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RESUMEN: Introducción. La caracterización genética del sistema HLA es de gran utilidad en estudios antropogenéticos, en la comprensión de mecanismos asociados a susceptibilidad o resistencia a diversas enfermedades, en los fenómenos inmunológicos durante el embarazo y en la selección de donantes/receptores en trasplantes de órganos. Objetivo. Determinar las frecuencias alélicas, genotípicas y haplotípicas HLA-A, -B, -DRB1 en donantes fallecidos en Medellín. Materiales y métodos. Se incluyeron 926 donantes entre febrero de 1989 y septiembre de 2006, a los cuales se les realizó la tipificación HLA-A, -B, -DRB1 por PCR-SSP (single specific primer-polymerase chain reaction) de mediana resolución. Las frecuencias alélicas, genotípicas y haplotípicas fueron estimadas mediante el algoritmo de máxima verosimilitud. Se evaluó el ajuste al equilibrio de Hardy-Weimberg por una prueba exacta análoga a la de Fisher usando la cadena de Markov, así como el desequilibrio de ligamiento entre pares de loci. Resultados. Se identificaron 22, 43 y 14 alelos para los loci HLA-A, -B, -DRB, respectivamente, de los cuales los más frecuentes fueron: A*02, A*24, B*35 y DRB1*04. En los loci HLA-A y -B se observó deficiencia en la frecuencia de heterocigóticos esperada (p<0,01 y p<0,00001, respectivamente). Los haplotipos más frecuentes fueron HLA-A*24, B*35 (7,7%), HLA-B*35 DRB1*04 (6,4%) y HLA-A*24, DRB1*04 (8,9%) para HLA-A, -DRB1, y para 3 loci fueron HLAA*24, B*35, DRB1*04 (4,6%) y HLA-A*24, B*61, DRB1*04 (2,0%). Conclusiones. Estos resultados corroboran la composición triétnica de nuestra población, en la cual predomina el grado de mezcla caucásica, a diferencia de otras latinoamericanas, y podrán ser usados como referencia para otros estudios y aplicaciones en esta población. Palabras clave: antígenos HLA/genética/análisis, frecuencia de los genes, haplotipos, genotipo, prueba de histocompatibilidad, humanos. |
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Rodríguez Padilla, Libia MaríaGiraldo Jiménez, Mabel CristinaGarcía González, NataliaVelásquez Castrillón, Laura IsabelParís Ángel, Sara ClaudiaÁlvarez Botero, Cristiam MauricioGarcía Moreno, Luis FernandoGrupo de Inmunología Celular e Inmunogenética2024-02-06T21:03:09Z2024-02-06T21:03:09Z2007Rodríguez LM, Giraldo MC, García N, Velásquez L, París SC, Álvarez CM, García LF. Frecuencias alélicas, genotípicas y haplotípicas HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 en donantes fallecidos, Medellín, Colombia. Biomédica [Internet]. 1 de diciembre de 2007 [citado 22 de noviembre de 2023];27(4):537-47. Disponible en: https://revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/1720120-4157https://hdl.handle.net/10495/3806610.7705/biomedica.v27i4.1722590-7379RESUMEN: Introducción. La caracterización genética del sistema HLA es de gran utilidad en estudios antropogenéticos, en la comprensión de mecanismos asociados a susceptibilidad o resistencia a diversas enfermedades, en los fenómenos inmunológicos durante el embarazo y en la selección de donantes/receptores en trasplantes de órganos. Objetivo. Determinar las frecuencias alélicas, genotípicas y haplotípicas HLA-A, -B, -DRB1 en donantes fallecidos en Medellín. Materiales y métodos. Se incluyeron 926 donantes entre febrero de 1989 y septiembre de 2006, a los cuales se les realizó la tipificación HLA-A, -B, -DRB1 por PCR-SSP (single specific primer-polymerase chain reaction) de mediana resolución. Las frecuencias alélicas, genotípicas y haplotípicas fueron estimadas mediante el algoritmo de máxima verosimilitud. Se evaluó el ajuste al equilibrio de Hardy-Weimberg por una prueba exacta análoga a la de Fisher usando la cadena de Markov, así como el desequilibrio de ligamiento entre pares de loci. Resultados. Se identificaron 22, 43 y 14 alelos para los loci HLA-A, -B, -DRB, respectivamente, de los cuales los más frecuentes fueron: A*02, A*24, B*35 y DRB1*04. En los loci HLA-A y -B se observó deficiencia en la frecuencia de heterocigóticos esperada (p<0,01 y p<0,00001, respectivamente). Los haplotipos más frecuentes fueron HLA-A*24, B*35 (7,7%), HLA-B*35 DRB1*04 (6,4%) y HLA-A*24, DRB1*04 (8,9%) para HLA-A, -DRB1, y para 3 loci fueron HLAA*24, B*35, DRB1*04 (4,6%) y HLA-A*24, B*61, DRB1*04 (2,0%). Conclusiones. Estos resultados corroboran la composición triétnica de nuestra población, en la cual predomina el grado de mezcla caucásica, a diferencia de otras latinoamericanas, y podrán ser usados como referencia para otros estudios y aplicaciones en esta población. Palabras clave: antígenos HLA/genética/análisis, frecuencia de los genes, haplotipos, genotipo, prueba de histocompatibilidad, humanos.ABSTRACT: Introduction. Genetic characterization of the human leucocyte antigen (HLA) system has provided insights into mechanisms of susceptibility to diverse diseases and immunological phenomena during pregnancy, as well as providing evidence for compatibility in the selection of organ transplant donors and recipients. Objective. The HLA-A,-B,-DRB1 allele, genotype and haplotype frequencies were determined in deceased organ donors in Medellín, Colombia. Materials and methods. The genotypes of 926 deceased donors were evaluated over a 17- year period (1989- 2006). HLA-A, HLA-B and HLA-DRB1 typing was performed by sequence specific primer-polymerase chain reaction (SSP-PCR). Maximum likelihood frequencies were estimated by the zipper version of expectation maximation algorithm. Hardy-Weinberg equilibrium were determined by an exact test analogous to Fisher’s test by using Markov’s chain, and linkage disequilibrium between pairs of loci. Results. Twenty-two, 43 and 14 alleles were identified for HLA-A, -B and -DRB loci, respectively. The most frequent were A*02, A*24, B*35, and DRB1*04. A deficiency in the proportion of heterozygotes in HLA-A and B loci (p<0.01 and p<0.00001, respectively). The most frequent haplotypes were as follows: HLA-A*24, B*35 (7.7%) for HLA-A,-B; HLA-B*35, DRB1*04 (6.4%) for HLA-B,-DRB1 and HLA-A*24, DRB1*04 (8.9%) for HLA-A,-DRB1. For the 3 loci HLA-A,-B,-DRB1, the most frequent haplotypes were A*24, B*35, DRB1*04 (4.6%) and A*24, B*61,DRB1*04 (2.0%). Conclusions. These results confirm the three-ethnic ancestry of the Medellin population. The predominance of Caucasian admixture differs from many other Latin-American populations and can serve as a reference for comparative studies of these populations as well as applications within the Medellin population.COL000863911application/pdfspaInstituto Nacional de SaludBogotá, Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Frecuencias alélicas, genotípicas y haplotípicas HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 en donantes fallecidos, Medellín, ColombiaHuman leucocyte antigen gene (HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1) frequencies in deceased organ donorsArtículo de investigaciónhttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1https://purl.org/redcol/resource_type/ARThttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionFrecuencia de los GenesGene FrequencyPredisposición Genética a la EnfermedadGenetic Predisposition to DiseaseAntígenos HLA-AHLA-A AntigensAntígenos HLA-BHLA-B AntigensAntígenos HLA-DRHLA-DR AntigensCadenas HLA-DRB1HLA-DRB1 ChainsHaplotiposHaplotypesGenotipoGenotypePrueba de HistocompatibilidadHistocompatibility Testinghttps://id.nlm.nih.gov/mesh/D005787https://id.nlm.nih.gov/mesh/D020022https://id.nlm.nih.gov/mesh/D015234https://id.nlm.nih.gov/mesh/D015235https://id.nlm.nih.gov/mesh/D006684https://id.nlm.nih.gov/mesh/D059811https://id.nlm.nih.gov/mesh/D006239https://id.nlm.nih.gov/mesh/D005838https://id.nlm.nih.gov/mesh/D006650Biomédica547453727BiomédicaPublicationORIGINALRodriguezLibia_2007_HaplotípicasAlelicasDonantes.pdfRodriguezLibia_2007_HaplotípicasAlelicasDonantes.pdfArtículo de investigaciónapplication/pdf187641https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/08fefc83-f3e2-4295-ac93-c959e6984697/download5fadfac4f0045e999695799b59852f59MD51trueAnonymousREADCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; 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