Caracterización de Candida spp. aisladas a partir de urocultivos en la ciudad de Medellín

RESUMEN: Candida spp. es un agente etiológico importante en infecciones del tracto urinario, principalmente en población con terapia antimicótica de amplio espectro y con catéteres urinarios. Candida albicans es la especie más frecuente, pero otras especies han surgido como patógenos emergentes. En...

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Autores:
Gómez Guzmán, Oscar Mauricio
Rúa Giraldo, Álvaro León
Hernández Ruiz, Orville
Duque Restrepo, Clara María
Sánchez Castaño, Diana Marcela
Gaviria, Ángela
Vallejo Acosta, Alexandra
Gómez, Beatriz
Tipo de recurso:
Article of investigation
Fecha de publicación:
2020
Institución:
Universidad de Antioquia
Repositorio:
Repositorio UdeA
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/44693
Acceso en línea:
https://hdl.handle.net/10495/44693
Palabra clave:
Candida
Filogenia
Phylogeny
Colombia
Infecciones Urinarias
Urinary Tract Infections
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https://id.nlm.nih.gov/mesh/D010802
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description RESUMEN: Candida spp. es un agente etiológico importante en infecciones del tracto urinario, principalmente en población con terapia antimicótica de amplio espectro y con catéteres urinarios. Candida albicans es la especie más frecuente, pero otras especies han surgido como patógenos emergentes. En este trabajo se recolectaron aislamientos de Candida spp. de urocultivos de pacientes que consultaron en Dinamica IPS entre enero 2016 y noviembre 2017. Para estimar la frecuencia de las especies y observar los patrones de sensibilidad, se realizó la identificación fenotípica y su perfil de sensibilidad con el sistema comercial Vitek 2® (BioMérieux, Inc.), adicionalmente se evaluaron mediante análisis de las secuencia y filogenética ITS1-5.8S-ITS2. En el estudio se incluyeron 78 aislamientos de Candida spp. Las frecuencias de especies de Candida identificadas empleando las herramientas moleculares fueron: C. albicans (38,5%), C. tropicalis (23,1%), C. glabrata (21,8%), C. parapsilosis (10,3%), C. metapsilosis y C. krusei (2,5%) y C. guillermondi (1,3%). La identificación por métodos moleculares y por el sistema Vitek 2 fue: C. albicans (93,3%), C. glabrata (94,1 %), C. tropicalis (83,3%), C. parapsilosis (75%) C. guilliermondii y C. krusei (100%). La sensibilidad de todos los aislamientos al fluconazol fue 93,6%
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Para estimar la frecuencia de las especies y observar los patrones de sensibilidad, se realizó la identificación fenotípica y su perfil de sensibilidad con el sistema comercial Vitek 2® (BioMérieux, Inc.), adicionalmente se evaluaron mediante análisis de las secuencia y filogenética ITS1-5.8S-ITS2. En el estudio se incluyeron 78 aislamientos de Candida spp. Las frecuencias de especies de Candida identificadas empleando las herramientas moleculares fueron: C. albicans (38,5%), C. tropicalis (23,1%), C. glabrata (21,8%), C. parapsilosis (10,3%), C. metapsilosis y C. krusei (2,5%) y C. guillermondi (1,3%). La identificación por métodos moleculares y por el sistema Vitek 2 fue: C. albicans (93,3%), C. glabrata (94,1 %), C. tropicalis (83,3%), C. parapsilosis (75%) C. guilliermondii y C. krusei (100%). La sensibilidad de todos los aislamientos al fluconazol fue 93,6%ABSTRACT: Candida spp is an important etiologic agent in urinary tract infections, mainly in patients in broad-spectrum antifungal therapy, with urinary catheters. Candida. albicans is the most frequent specie; but other species have arised as emerging pathogens. In this study, isolates of Candida spp. of urine cultures from patients who consulted in Dinamica IPS between January 2016 and November 2017 were evaluated. To estimate the frequency of the species and to observe the sensitivity patterns, the phenotypic identification and its sensitivity profile was performed employed the Vitek 2® commercial system. (BioMérieux, Inc) In addition the iso- lates were evaluated by sequence analysis and phylogenetics ITS1-5.8S-ITS2. This study included 78 isolates of Candida spp. The frequencies of Candida species identified using the molecular tools were: C. albicans (38.5%), C. tropicalis (23.1%), C. glabrata (21.8%), C. parapsilosis (10.3%), C. guillermondi (1.3%) and C. metap- silosis and C. krusei (2.5%). The identification by molecular methods and by Vitek 2 system were: C. albicans (93.3%), for C. glabrata (94.1%), C. tropicalis (83.3%), C. parapsilosis (75%) and 100% for C. guilliermondii and C. krusei.. fluconazole sensitivity of all isolates was 93.6%.COL00009627 páginasapplication/pdfspaAsociación Colombiana de InfectologíaBogotá, Colombiahttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Caracterización de Candida spp. aisladas a partir de urocultivos en la ciudad de MedellínCharacterization of Candida spp isolated from urine cultures of MedellínArtículo de investigaciónhttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1https://purl.org/redcol/resource_type/ARThttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionCandidaFilogeniaPhylogenyColombiaInfecciones UrinariasUrinary Tract Infectionshttps://id.nlm.nih.gov/mesh/D002175https://id.nlm.nih.gov/mesh/D010802https://id.nlm.nih.gov/mesh/D003105https://id.nlm.nih.gov/mesh/D014552Infectio223421724InfectioPublicationORIGINALGomezOscar_2020_Caracterizacion_Candida_spp_Urocultivos.pdfGomezOscar_2020_Caracterizacion_Candida_spp_Urocultivos.pdfArtículo de investigaciónapplication/pdf659323https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/ab7f3cd8-8d07-4963-bc48-e6b6dc566076/downloadc83d3a5292639b1300fa8bc90cc7ea3eMD51trueAnonymousREADCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; 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