Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica

RESUMEN: Recientemente se introdujo en el diagnóstico de malaria una técnica llamada amplificación isotérmica de ácidos nucleicos, que usa el material genético plasmodial. Este escrito revisa la información disponible sobre amplificación isotérmica de ácidos nucleicos, especialmente en el campo del...

Full description

Autores:
Carmona Fonseca, Jaime de Jesús
Maestre Buitrago, Amanda Elena
Sosa Villa, Paula Andrea
Morales Londoño, Gloria Patricia
Arroyo Arroyo, María Isabel
Tipo de recurso:
Review article
Fecha de publicación:
2008
Institución:
Universidad de Antioquia
Repositorio:
Repositorio UdeA
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/35101
Acceso en línea:
https://hdl.handle.net/10495/35101
https://revistas.uis.edu.co/index.php/revistamedicasuis/article/view/12314
Palabra clave:
Malaria
Plasmodium
Diagnosis
Diagnóstico
Rights
openAccess
License
http://creativecommons.org/licenses/by/2.5/co/
id UDEA2_ca6a27597fb29a1ea791dc8c443d384c
oai_identifier_str oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/35101
network_acronym_str UDEA2
network_name_str Repositorio UdeA
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica
dc.title.translated.spa.fl_str_mv Isothermal Nucleic Acid Amplification Type LAMP for the Detection of Plasmodium: A New Diagnostic Technique
title Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica
spellingShingle Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica
Malaria
Plasmodium
Diagnosis
Diagnóstico
title_short Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica
title_full Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica
title_fullStr Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica
title_full_unstemmed Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica
title_sort Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica
dc.creator.fl_str_mv Carmona Fonseca, Jaime de Jesús
Maestre Buitrago, Amanda Elena
Sosa Villa, Paula Andrea
Morales Londoño, Gloria Patricia
Arroyo Arroyo, María Isabel
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Carmona Fonseca, Jaime de Jesús
Maestre Buitrago, Amanda Elena
Sosa Villa, Paula Andrea
Morales Londoño, Gloria Patricia
Arroyo Arroyo, María Isabel
dc.contributor.researchgroup.spa.fl_str_mv Salud y Comunidad
dc.subject.decs.none.fl_str_mv Malaria
Plasmodium
Diagnosis
Diagnóstico
topic Malaria
Plasmodium
Diagnosis
Diagnóstico
description RESUMEN: Recientemente se introdujo en el diagnóstico de malaria una técnica llamada amplificación isotérmica de ácidos nucleicos, que usa el material genético plasmodial. Este escrito revisa la información disponible sobre amplificación isotérmica de ácidos nucleicos, especialmente en el campo del paludismo. Metodología: se revisaron las bases electrónicas Lilacs, Scielo, PubMed (Medline) y Ovid. Resultados: solo se encontraron tres referencias sobre amplificación isotérmica de ácidos nucleicos y malaria pero hubo abundante información sobre amplificación isotérmica de ácidos nucleicos en otras infecciones y campos de la medicina, en especial la infectología. La reacción de amplificación isotérmica de ácidos nucleicos requiere de una ADN polimerasa con actividad de desplazamiento de cadena y cuatro cebadores especialmente diseñados para reconocer seis secuencias distintas. Esto garantiza alta especificidad para la amplificación. Varias alternativas de amplificación isotérmica de ácidos nucleicos se han desarrollado para la identificación de virus, bacterias, micoplasmas, protozoos, hongos y levaduras. Ventajas de amplificación isotérmica de ácidos nucleicos son capacidad de amplificar ácidos nucleicos bajo condiciones isotérmicas (60-65 ºC); posibilidad de lectura y semicuantificación a simple vista y de cuantificación con un turbidímetro; altas sensibilidad y especificidad y, en general, capacidad diagnóstica; rapidez, bajo costo y facilidad de aplicación; tolera los componentes de los medios de cultivo y las sustancias biológicas. Entre las desventajas están que la baja concentración de ADN molde disminuye la eficacia del reconocimiento de los cebadores; la observación de la turbidez fue menos sensible que la visualización de los productos en gel de agarosa teñidos con bromuro de etidio y es crítica la prevención de la contaminación.
publishDate 2008
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2008
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2023-05-24T20:01:43Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2023-05-24T20:01:43Z
dc.type.spa.fl_str_mv Artículo de revisión
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_dcae04bc
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv https://purl.org/redcol/resource_type/ARTREV
dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format http://purl.org/coar/resource_type/c_dcae04bc
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.spa.fl_str_mv Arroyo A MI, Morales L GP, Sosa V PA, Carmona-Fonseca J, Maestre B A. Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica. Méd.UIS [Internet]. 18 de diciembre de 2008 [citado de de 20--];21(3):158-75. Disponible en: https://revistas.uis.edu.co/index.php/revistamedicasuis/article/view/12314
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv 0121-0319
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/10495/35101
dc.identifier.eissn.none.fl_str_mv 1794-5240
dc.identifier.url.spa.fl_str_mv https://revistas.uis.edu.co/index.php/revistamedicasuis/article/view/12314
identifier_str_mv Arroyo A MI, Morales L GP, Sosa V PA, Carmona-Fonseca J, Maestre B A. Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica. Méd.UIS [Internet]. 18 de diciembre de 2008 [citado de de 20--];21(3):158-75. Disponible en: https://revistas.uis.edu.co/index.php/revistamedicasuis/article/view/12314
0121-0319
1794-5240
url https://hdl.handle.net/10495/35101
https://revistas.uis.edu.co/index.php/revistamedicasuis/article/view/12314
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartofjournalabbrev.spa.fl_str_mv Med. UIS.
dc.relation.citationendpage.spa.fl_str_mv 175
dc.relation.citationissue.spa.fl_str_mv 3
dc.relation.citationstartpage.spa.fl_str_mv 158
dc.relation.citationvolume.spa.fl_str_mv 21
dc.relation.ispartofjournal.spa.fl_str_mv Médicas UIS
dc.rights.uri.*.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by/2.5/co/
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by/2.5/co/
https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.extent.spa.fl_str_mv 18
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.place.spa.fl_str_mv Bucaramanga, Colombia
dc.publisher.faculty.spa.fl_str_mv sin facultad - programa
institution Universidad de Antioquia
bitstream.url.fl_str_mv https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/06863c74-59e1-4099-88ff-e48fedd0bafd/download
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/e8566add-d203-4613-8f36-dcd61a7bd348/download
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/05833ff3-4d19-405c-8350-686e3cef8aaf/download
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/52819ed4-18fa-44ac-8c1a-36be2525278b/download
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/bbd49986-3456-4ec0-b784-290e1fd79b93/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
567b799467ab8ea6c7c36e6d16601c0d
1646d1f6b96dbbbc38035efc9239ac9c
fb2c2ec8a0d22878ae1fbacfe949f860
ed85910381ec938f282d730bd8bf4844
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional de la Universidad de Antioquia
repository.mail.fl_str_mv aplicacionbibliotecadigitalbiblioteca@udea.edu.co
_version_ 1851052581681364992
spelling Carmona Fonseca, Jaime de JesúsMaestre Buitrago, Amanda ElenaSosa Villa, Paula AndreaMorales Londoño, Gloria PatriciaArroyo Arroyo, María IsabelSalud y Comunidad2023-05-24T20:01:43Z2023-05-24T20:01:43Z2008Arroyo A MI, Morales L GP, Sosa V PA, Carmona-Fonseca J, Maestre B A. Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnóstica. Méd.UIS [Internet]. 18 de diciembre de 2008 [citado de de 20--];21(3):158-75. Disponible en: https://revistas.uis.edu.co/index.php/revistamedicasuis/article/view/123140121-0319https://hdl.handle.net/10495/351011794-5240https://revistas.uis.edu.co/index.php/revistamedicasuis/article/view/12314RESUMEN: Recientemente se introdujo en el diagnóstico de malaria una técnica llamada amplificación isotérmica de ácidos nucleicos, que usa el material genético plasmodial. Este escrito revisa la información disponible sobre amplificación isotérmica de ácidos nucleicos, especialmente en el campo del paludismo. Metodología: se revisaron las bases electrónicas Lilacs, Scielo, PubMed (Medline) y Ovid. Resultados: solo se encontraron tres referencias sobre amplificación isotérmica de ácidos nucleicos y malaria pero hubo abundante información sobre amplificación isotérmica de ácidos nucleicos en otras infecciones y campos de la medicina, en especial la infectología. La reacción de amplificación isotérmica de ácidos nucleicos requiere de una ADN polimerasa con actividad de desplazamiento de cadena y cuatro cebadores especialmente diseñados para reconocer seis secuencias distintas. Esto garantiza alta especificidad para la amplificación. Varias alternativas de amplificación isotérmica de ácidos nucleicos se han desarrollado para la identificación de virus, bacterias, micoplasmas, protozoos, hongos y levaduras. Ventajas de amplificación isotérmica de ácidos nucleicos son capacidad de amplificar ácidos nucleicos bajo condiciones isotérmicas (60-65 ºC); posibilidad de lectura y semicuantificación a simple vista y de cuantificación con un turbidímetro; altas sensibilidad y especificidad y, en general, capacidad diagnóstica; rapidez, bajo costo y facilidad de aplicación; tolera los componentes de los medios de cultivo y las sustancias biológicas. Entre las desventajas están que la baja concentración de ADN molde disminuye la eficacia del reconocimiento de los cebadores; la observación de la turbidez fue menos sensible que la visualización de los productos en gel de agarosa teñidos con bromuro de etidio y es crítica la prevención de la contaminación.ABSTRACT: Introduction: isothermal nucleic acid amplifi cation (LAMP) was recently reported in the diagnosis of malaria. This uses plasmodial DNA to confi rm the diagnosis. This paper reviews the most relevant available information on LAMP, especially in the fi eld of malaria. Methodology: the electronic databases Lilacs, Scielo, PubMed (Medline) and Ovid, were reviewed. Results: only three references were found on LAMP and malaria but there was abundant information on LAMP and other infections in fi elds of medicine, mainly in infectious diseases. The LAMP reaction requires a strand displacement DNA polymerase and a system of four primers specifi cally designed to recognize a total of six different sequences in the DNA target. This guarantees high specifi city. Several alternatives of LAMP have been developed to identify viruses, bacteria, mycoplasma, protozoa, fungi and yeast. Advantages of LAMP: ability to amplify nucleic acids under isothermal conditions (60 and 65 ºC9; possibility of semi-quantitative reading by observation and quantitative interpretation using a turbidimeter ; high sensitivity and specifi city and, in general, diagnostic capacity, speed, low cost and ease of implementation; better performance than PCR when culture media and biological substances are processed. Disadvantages: the low concentration of DNA template reduces the primers effi cacy recognition; turbidimetry was less sensitive than the agarose gel and ethidium bromide analysis, prevention of contamination is critical.COL004744918application/pdfspaUniversidad Industrial de SantanderBucaramanga, Colombiasin facultad - programahttp://creativecommons.org/licenses/by/2.5/co/https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Amplificación isotérmica de ácidos nucleicos tipo LAMP para la detección de Plasmodium: nueva técnica diagnósticaIsothermal Nucleic Acid Amplification Type LAMP for the Detection of Plasmodium: A New Diagnostic TechniqueArtículo de revisiónhttp://purl.org/coar/resource_type/c_dcae04bchttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1https://purl.org/redcol/resource_type/ARTREVhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionMalariaPlasmodiumDiagnosisDiagnósticoMed. UIS.175315821Médicas UISPublicationLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/06863c74-59e1-4099-88ff-e48fedd0bafd/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD53falseAnonymousREADORIGINALCarmonaJaime_2008_AmplificaciónIsotérmicaPlasmodium.pdfCarmonaJaime_2008_AmplificaciónIsotérmicaPlasmodium.pdfArtículo de revisiónapplication/pdf402448https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/e8566add-d203-4613-8f36-dcd61a7bd348/download567b799467ab8ea6c7c36e6d16601c0dMD51trueAnonymousREADCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8927https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/05833ff3-4d19-405c-8350-686e3cef8aaf/download1646d1f6b96dbbbc38035efc9239ac9cMD52falseAnonymousREADTEXTCarmonaJaime_2008_AmplificaciónIsotérmicaPlasmodium.pdf.txtCarmonaJaime_2008_AmplificaciónIsotérmicaPlasmodium.pdf.txtExtracted texttext/plain66206https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/52819ed4-18fa-44ac-8c1a-36be2525278b/downloadfb2c2ec8a0d22878ae1fbacfe949f860MD54falseAnonymousREADTHUMBNAILCarmonaJaime_2008_AmplificaciónIsotérmicaPlasmodium.pdf.jpgCarmonaJaime_2008_AmplificaciónIsotérmicaPlasmodium.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg12648https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/bbd49986-3456-4ec0-b784-290e1fd79b93/downloaded85910381ec938f282d730bd8bf4844MD55falseAnonymousREAD10495/35101oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/351012025-03-27 00:36:43.739http://creativecommons.org/licenses/by/2.5/co/open.accesshttps://bibliotecadigital.udea.edu.coRepositorio Institucional de la Universidad de Antioquiaaplicacionbibliotecadigitalbiblioteca@udea.edu.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

Publicaciones similares