Análisis comparativo de las redes transcripcionales durante la gastrulación en Acropora : ¿conservación o divergencia durante el desarrollo temprano en la base de Metazoa?

La gastrulación es un proceso morfogenético que origina las capas germinales y establece el plan corporal primario. A pesar de que es un proceso conservado en todos los eumetazoa, los modos en que ocurre son diversos y no se considera útil para reconstruir historias evolutivas. Esto desafía la idea de que los principios básicos que regulan la morfogénesis animal están determinados por módulos de regulación genómica ancestrales. En contraste, estudios recientes que utilizan datos moleculares, como los datos de expresión génica de RNA-seq, han respaldado en gran medida que el desarrollo embrionario tiende a ser divergente. Para comprender hasta qué punto los cambios en la expresión génica que regulan las transiciones morfogenéticas que ocurren durante la gastrulación se conservan en Acropora, se examinó la expresión génica en tres etapas del desarrollo temprano en los corales A. digitifera y A. tenuis. Los análisis de expresión génica diferencial acoplados a los análisis de ortología permitieron identificar un módulo conservado de 3377 genes que participan en el desarrollo temprano de ambas especies. Estos resultados, junto con los análisis de redes PPi permitieron identificar varios genes centrales conservados implicados en el desarrollo. Sin embargo, los patrones de expresión génica, el enriquecimiento funcional y los análisis cuantitativos comparativos del transcriptoma demuestran tendencias heterocrónicas de la expresión. Estos hallazgos proporcionan un marco de evidencias de los mecanismos moleculares conservados y una resolución temporal que captura la dinámica de expresión génica que subyace al desarrollo.

• Autores: Ossa Gómez, Juan Pablo
• Fecha de publicación: 2023
• Institución: Universidad de Antioquia
• Repositorio: Repositorio UdeA
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/45721
• Acceso en línea: https://hdl.handle.net/10495/45721
• Palabra clave: Acropora; Gastrulación; Gastrulation; RNA-Seq; Desarrollo embrionario; Embryonic development; http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_2545; http://id.loc.gov/authorities/subjects/sh89005322; https://id.nlm.nih.gov/mesh/D054262; https://id.nlm.nih.gov/mesh/D000081246
• Rights: openAccess
• License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/