Variabilidad genómica de Mycobacterium tuberculosis como elemento explicativo del alto riesgo para tuberculosis del departamento de Norte de Santander

RESUMEN: La TB es un problema de salud pública creciente en el mundo. En Norte de Santander- Colombia, el número de casos nuevos notificados ha ido en aumento en los últimos años, convirtiéndolo en el año 2021, en uno de los departamentos de Colombia con mayor carga de TB. El objetivo principal de este estudio fue determinar si la alta transmisión de TB en Norte de Santander está definida por un linaje especifico de Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis), para lo cual se diseñó un estudio prospectivo de corte transversal donde se incluyeron 215 aislamientos a conveniencia de M. tuberculosis provenientes de casos de TB notificados por el laboratorio clínico en la ESE-HUEM de Cúcuta, Norte de Santander durante 2015-2018. Se caracterizaron molecularmente 207 aislamientos de M. tuberculosis, usando las herramientas de spoligotyping, MIRU-VNTR y secuenciación de genoma completo. Se combinaron análisis moleculares y SIG para mostrar la ubicación de los casos de TB y la diversidad genética de los aislamientos en Norte de Santander. Se evidenciaron microepidemias en zonas urbanas y en población socialmente marginada además de la existencia de prevalencia oculta de la enfermedad, ambas responsables de mantener la cadena de transmisión. Además, se logró la identificación de linajes mediante spoligotyping mostrando que los aislamientos estudiados pertenecían a LAM (41,1%), Haarlem (11,1%), T (8,2%), Desconocido (2,9%), X (1%), Beijing (1%) y a un grupo de genotipos huérfanos (34,8%). La WGS permitió evidenciar 5 sublinajes del Linaje 4: 4.1.2.1, 4.3.2, 4.3.3, 4.3.4.1, 4.3.4.2 y 4,8 mientras el análisis de la genómica comparativa reveló diversas modificaciones génicas frente a genomas de referencia universal H37Rv y colombiano UT205. Este estudio permitió demostrar que para los casos de TB, la transmisión en los municipios y comunas en Norte de Santander no está determinada por uno o varios genotipos específicos dado que éstos, están circulando indistintamente en localidades de alto y bajo riesgo. Se requiere de intervenciones tempranas para interrumpir los eventos de transmisión presentes en población marginada del departamento de Norte de Santander.

• Autores: Bohada Lizarazo, Diana Patricia
• Tipo de recurso: Doctoral thesis
• Fecha de publicación: 2023
• Institución: Universidad de Antioquia
• Repositorio: Repositorio UdeA
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/42597
• Acceso en línea: https://hdl.handle.net/10495/42597
• Palabra clave: Mycobacterium tuberculosis; Tuberculosis - Transmisión; Tuberculosis - Transmission; Técnicas de genotipaje; Genotyping techniques; Genotipificación; Norte de Santander (Colombia); https://id.nlm.nih.gov/mesh/D009169; https://id.nlm.nih.gov/mesh/D014376; https://id.nlm.nih.gov/mesh/D060005
• Rights: openAccess
• License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/co/