IL-10 gene promoter polymorphisms and leprosy in a Colombian population sample

RESUMEN: Introducción. Se han reportado polimorfismos en los genes promotores que codifican para citocinas y que afectan los niveles de transcripción, con implicaciones clínicas y funcionales en pacientes con lepra. Objetivo. Detectar los polimorfismos en el gen promotor de la interleucina 10 (IL-10...

Full description

Autores:
Rojas Montoya, Winston
Bedoya Berrío, Gabriel deJesús
Cardona Castro, Nora
Sánchez Jiménez, Miryan
Tipo de recurso:
Article of investigation
Fecha de publicación:
2012
Institución:
Universidad de Antioquia
Repositorio:
Repositorio UdeA
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/30910
Acceso en línea:
https://hdl.handle.net/10495/30910
https://revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/386
Palabra clave:
Lepra
Leprosy
Interleucina-10
Interleukin-10
Citocinas
Cytokines
Regiones promotoras genéticas
Promoter Regions, Genetic
Polimorfismo de nucleótido simple
C01.150.252.410.040.552.475.371
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016753
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016207
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D011401
Polymorphism, Single Nucleotide
Rights
openAccess
License
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
id UDEA2_482e1c77caf3af4af25169dd94ef4d83
oai_identifier_str oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/30910
network_acronym_str UDEA2
network_name_str Repositorio UdeA
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv IL-10 gene promoter polymorphisms and leprosy in a Colombian population sample
dc.title.translated.spa.fl_str_mv Polimorfismos en el gen promotor de IL-10 en una muestra de pacientes colombianos con lepra
title IL-10 gene promoter polymorphisms and leprosy in a Colombian population sample
spellingShingle IL-10 gene promoter polymorphisms and leprosy in a Colombian population sample
Lepra
Leprosy
Interleucina-10
Interleukin-10
Citocinas
Cytokines
Regiones promotoras genéticas
Promoter Regions, Genetic
Polimorfismo de nucleótido simple
C01.150.252.410.040.552.475.371
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016753
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016207
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D011401
Polymorphism, Single Nucleotide
title_short IL-10 gene promoter polymorphisms and leprosy in a Colombian population sample
title_full IL-10 gene promoter polymorphisms and leprosy in a Colombian population sample
title_fullStr IL-10 gene promoter polymorphisms and leprosy in a Colombian population sample
title_full_unstemmed IL-10 gene promoter polymorphisms and leprosy in a Colombian population sample
title_sort IL-10 gene promoter polymorphisms and leprosy in a Colombian population sample
dc.creator.fl_str_mv Rojas Montoya, Winston
Bedoya Berrío, Gabriel deJesús
Cardona Castro, Nora
Sánchez Jiménez, Miryan
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Rojas Montoya, Winston
Bedoya Berrío, Gabriel deJesús
Cardona Castro, Nora
Sánchez Jiménez, Miryan
dc.contributor.researchgroup.spa.fl_str_mv Genética Molecular (GENMOL)
dc.subject.decs.none.fl_str_mv Lepra
Leprosy
Interleucina-10
Interleukin-10
Citocinas
Cytokines
Regiones promotoras genéticas
Promoter Regions, Genetic
Polimorfismo de nucleótido simple
topic Lepra
Leprosy
Interleucina-10
Interleukin-10
Citocinas
Cytokines
Regiones promotoras genéticas
Promoter Regions, Genetic
Polimorfismo de nucleótido simple
C01.150.252.410.040.552.475.371
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016753
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016207
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D011401
Polymorphism, Single Nucleotide
dc.subject.meshuri.none.fl_str_mv C01.150.252.410.040.552.475.371
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016753
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016207
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D011401
Polymorphism, Single Nucleotide
description RESUMEN: Introducción. Se han reportado polimorfismos en los genes promotores que codifican para citocinas y que afectan los niveles de transcripción, con implicaciones clínicas y funcionales en pacientes con lepra. Objetivo. Detectar los polimorfismos en el gen promotor de la interleucina 10 (IL-10), de los polimorfismos de un solo nucleótido (Single Nucleotide Polymorphisms, SNP) -1082 A/G (rs1800896), -819C/T (rs1800871) y -592A/C (rs1800872), en 100 pacientes con lepra y un grupo control de 100 voluntarios, de una región endémica de Colombia. Resultados. Los haplotipos -819C-519C y -1082A-819C-592C mostraron asociación significativa con lepra: OR=4,34, p=1 x 10-3, y OR=6,25, p=5 x 10-4, respectivamente. Estos haplotipos en condiciones de homocigoto, están también asociados con lepra: -819C-519C/-819C-519C (OR=4,34 p=1 x 10-3), -1082A -819C-592C/-1082A -819C-592C (OR=1,90 y p=0,04). El SNP -1082 no se encontró asociado con lepra en esta población. Los genotipos C/C y C/T en el SNP -819, se encontraron asociados a lepra (OR=4,34, p=1 x 10-3); de igual manera, los genotipos C/C y C/A en el SNP -592 mostraron asociación (OR=4,34, p=1 x 10-3). Conclusiones. El haplotipo que encontramos asociado con lepra, -1082A-819C-592C/-1082A-819C-592C, se ha relacionado con baja producción de IL-10. Funcionalmente, esta baja producción de IL-10 puede tener consecuencias en la respuesta inmunitaria, además de implicaciones clínicas. Se han reportado diferentes haplotipos de IL-10 como marcadores de vulnerabilidad y resistencia de lepra en otras poblaciones, lo cual sugiere que las diferencias en la distribución de diversos polimorfismos del gen de IL-10 entre grupos étnicos, es un factor importante al determinar la asociación entre enfermedad y genes.
publishDate 2012
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2012
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2022-09-27T14:23:56Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2022-09-27T14:23:56Z
dc.type.spa.fl_str_mv Artículo de investigación
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv https://purl.org/redcol/resource_type/ART
dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.spa.fl_str_mv Cardona-Castro N, Sánchez-Jiménez M, Rojas W, Bedoya-Berrío G. Polimorfismos en el gen promotor de IL-10 en una muestra de pacientes colombianos con lepra. biomedica [Internet]. 1 de marzo de 2012 [citado 17 de julio de 2022];32(1):71-6. Disponible en: https://revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/386
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv 0120-4157
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/10495/30910
dc.identifier.doi.none.fl_str_mv 10.7705/biomedica.v32i1.386
dc.identifier.eissn.none.fl_str_mv 2590-7379
dc.identifier.url.spa.fl_str_mv https://revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/386
identifier_str_mv Cardona-Castro N, Sánchez-Jiménez M, Rojas W, Bedoya-Berrío G. Polimorfismos en el gen promotor de IL-10 en una muestra de pacientes colombianos con lepra. biomedica [Internet]. 1 de marzo de 2012 [citado 17 de julio de 2022];32(1):71-6. Disponible en: https://revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/386
0120-4157
10.7705/biomedica.v32i1.386
2590-7379
url https://hdl.handle.net/10495/30910
https://revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/386
dc.language.iso.spa.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.ispartofjournalabbrev.spa.fl_str_mv Biomédica
dc.relation.citationendpage.spa.fl_str_mv 6
dc.relation.citationissue.spa.fl_str_mv 1
dc.relation.citationstartpage.spa.fl_str_mv 1
dc.relation.citationvolume.spa.fl_str_mv 32
dc.relation.ispartofjournal.spa.fl_str_mv Biomédica
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.uri.*.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.extent.spa.fl_str_mv 6
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Instituto Nacional de Salud
dc.publisher.place.spa.fl_str_mv Bogotá, Colombia
institution Universidad de Antioquia
bitstream.url.fl_str_mv https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/4a424b41-e733-4059-93f7-756f79ec922b/download
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/1c412210-ce58-4626-8c61-07c62745c58c/download
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/c821e8e7-53e8-454e-88bc-77fc3c84591a/download
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/fdbcf288-5d6f-4312-b9a7-c4c18ec73b18/download
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/7a0f5d29-69fe-4700-98f8-e2f0fe68c7e8/download
bitstream.checksum.fl_str_mv b88b088d9957e670ce3b3fbe2eedbc13
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
c0481c97044293f1cedad2455f44eb82
71f2e26f52032de5d489a46ffaaef2a2
3d4bc87b7287c4dab9ff9e4d07a4f5fd
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional de la Universidad de Antioquia
repository.mail.fl_str_mv aplicacionbibliotecadigitalbiblioteca@udea.edu.co
_version_ 1851052629801566208
spelling Rojas Montoya, WinstonBedoya Berrío, Gabriel deJesúsCardona Castro, NoraSánchez Jiménez, MiryanGenética Molecular (GENMOL)2022-09-27T14:23:56Z2022-09-27T14:23:56Z2012Cardona-Castro N, Sánchez-Jiménez M, Rojas W, Bedoya-Berrío G. Polimorfismos en el gen promotor de IL-10 en una muestra de pacientes colombianos con lepra. biomedica [Internet]. 1 de marzo de 2012 [citado 17 de julio de 2022];32(1):71-6. Disponible en: https://revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/3860120-4157https://hdl.handle.net/10495/3091010.7705/biomedica.v32i1.3862590-7379https://revistabiomedica.org/index.php/biomedica/article/view/386RESUMEN: Introducción. Se han reportado polimorfismos en los genes promotores que codifican para citocinas y que afectan los niveles de transcripción, con implicaciones clínicas y funcionales en pacientes con lepra. Objetivo. Detectar los polimorfismos en el gen promotor de la interleucina 10 (IL-10), de los polimorfismos de un solo nucleótido (Single Nucleotide Polymorphisms, SNP) -1082 A/G (rs1800896), -819C/T (rs1800871) y -592A/C (rs1800872), en 100 pacientes con lepra y un grupo control de 100 voluntarios, de una región endémica de Colombia. Resultados. Los haplotipos -819C-519C y -1082A-819C-592C mostraron asociación significativa con lepra: OR=4,34, p=1 x 10-3, y OR=6,25, p=5 x 10-4, respectivamente. Estos haplotipos en condiciones de homocigoto, están también asociados con lepra: -819C-519C/-819C-519C (OR=4,34 p=1 x 10-3), -1082A -819C-592C/-1082A -819C-592C (OR=1,90 y p=0,04). El SNP -1082 no se encontró asociado con lepra en esta población. Los genotipos C/C y C/T en el SNP -819, se encontraron asociados a lepra (OR=4,34, p=1 x 10-3); de igual manera, los genotipos C/C y C/A en el SNP -592 mostraron asociación (OR=4,34, p=1 x 10-3). Conclusiones. El haplotipo que encontramos asociado con lepra, -1082A-819C-592C/-1082A-819C-592C, se ha relacionado con baja producción de IL-10. Funcionalmente, esta baja producción de IL-10 puede tener consecuencias en la respuesta inmunitaria, además de implicaciones clínicas. Se han reportado diferentes haplotipos de IL-10 como marcadores de vulnerabilidad y resistencia de lepra en otras poblaciones, lo cual sugiere que las diferencias en la distribución de diversos polimorfismos del gen de IL-10 entre grupos étnicos, es un factor importante al determinar la asociación entre enfermedad y genes.ABSTRACT:ntroduction. Polymorphisms in promoters of genes code for cytokines that affect transcription levels. Several have been associated with leprosy patients that have functional and clinical implications. Objective. Polymorphisms in the promoter of the IL10 gene of leprosy patients will be compared frequencies in normal population.Materials and methods. SNPs (single nucleotide polymorphism) -1082 A/G (rs1800896), -819C/T (rs1800871), and -592A/C (rs1800872) were identified in 100 leprosy patients and in a control group of 100 volunteers from a leprosy endemic region of Colombia.Results. The genotypes C/C and C/T in the SNP -819 were associated together with leprosy (OR=4.34, p<0.001). Similarly, the genotypes C/C and C/A in the -592 SNP showed an association (OR=4.3, p<0.001). The haplotypes -819C-519C and -1082A-819C-592C showed significant association (OR=4.34, p<0.001 and OR=6.25, p<0.001) respectively. These haplotypes in homozygosis conditions were also associated with leprosy: -819C-519C/-819C-519C (OR=4.34, p<0.001), -1082A -819C-592C/-1082A -819C-592C (OR=1.90, p=0.04). The SNP -1082 was not associated with leprosy in this population.Conclusions. The haplotypes associated with leprosy, -1082A-819C-592C/-1082A-819C-592C, have been reported as low producers of IL-10. Functionally, the low production of IL-10 may have immune response consequences and clinical implications. Additional haplotypes of IL-10 have been reported as markers for leprosy susceptibility or resistance in other ethnic populations. This suggests that differences in distribution of diverse IL-10 gene polymorphisms among ethnic groups may indicate important gene-disease associationsColombia. Ministerio de Ciencia, Tecnología e InnovaciónCOL00067236application/pdfengInstituto Nacional de SaludBogotá, Colombiahttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2IL-10 gene promoter polymorphisms and leprosy in a Colombian population samplePolimorfismos en el gen promotor de IL-10 en una muestra de pacientes colombianos con lepraArtículo de investigaciónhttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1https://purl.org/redcol/resource_type/ARThttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionLepraLeprosyInterleucina-10Interleukin-10CitocinasCytokinesRegiones promotoras genéticasPromoter Regions, GeneticPolimorfismo de nucleótido simpleC01.150.252.410.040.552.475.371https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016753https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016207https://id.nlm.nih.gov/mesh/D011401Polymorphism, Single NucleotideBiomédica61132Biomédicagrid.433658.f325651928980PublicationCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8823https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/4a424b41-e733-4059-93f7-756f79ec922b/downloadb88b088d9957e670ce3b3fbe2eedbc13MD52falseAnonymousREADLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/1c412210-ce58-4626-8c61-07c62745c58c/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD53falseAnonymousREADORIGINALRojasWinston_2012_IL-10GenePromoterPolymorphisms.pdfRojasWinston_2012_IL-10GenePromoterPolymorphisms.pdfArtículo de investigaciónapplication/pdf504102https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/c821e8e7-53e8-454e-88bc-77fc3c84591a/downloadc0481c97044293f1cedad2455f44eb82MD51trueAnonymousREADTEXTRojasWinston_2012_IL-10GenePromoterPolymorphisms.pdf.txtRojasWinston_2012_IL-10GenePromoterPolymorphisms.pdf.txtExtracted texttext/plain27471https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/fdbcf288-5d6f-4312-b9a7-c4c18ec73b18/download71f2e26f52032de5d489a46ffaaef2a2MD54falseAnonymousREADTHUMBNAILRojasWinston_2012_IL-10GenePromoterPolymorphisms.pdf.jpgRojasWinston_2012_IL-10GenePromoterPolymorphisms.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg14516https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/7a0f5d29-69fe-4700-98f8-e2f0fe68c7e8/download3d4bc87b7287c4dab9ff9e4d07a4f5fdMD55falseAnonymousREAD10495/30910oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/309102025-03-27 01:19:12.925https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/open.accesshttps://bibliotecadigital.udea.edu.coRepositorio Institucional de la Universidad de Antioquiaaplicacionbibliotecadigitalbiblioteca@udea.edu.coTk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0Cm93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLAp0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZwp0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sCmluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlCnN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yCnB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZQp0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQKdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uCmFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LAp5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZQpjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdApzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkCndpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRApCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUKRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSApDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZQpzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMKbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo=