Caracterización molecular del gen supresor de tumores TP53 en el cáncer colorrectal

RESUMEN: Introducción: El cáncer colorrectal (CCR) es una de las neoplasias más comunes en el mundo; especialmente, en los países desarrollados. En Colombia, la incidencia del CCR ocupa el cuarto lugar en hombres y mujeres; el CCR tiene una gran heterogeneidad genética. Objetivo: Determinar la prese...

Full description

Autores:
Palacio Rúa, Katherine Andrea
Ceballos García, Hamilton Alfonso
Ahumada Rodríguez, Enoc Jesús
Isaza Jiménez, Luis Fernando
Muñetón Peña, Carlos Mario
Tipo de recurso:
Article of investigation
Fecha de publicación:
2013
Institución:
Universidad de Antioquia
Repositorio:
Repositorio UdeA
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/38723
Acceso en línea:
https://hdl.handle.net/10495/38723
Palabra clave:
Neoplasias Colorrectales
Colorectal Neoplasms
Genes p53
Genes, p53
Heterogeneidad Genética
Genetic Heterogeneity
Carcinogénesis
Carcinogenesis
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D015179
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016158
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D018740
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D063646
Rights
openAccess
License
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/
id UDEA2_026745fb93df429daf3a2da20d9123de
oai_identifier_str oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/38723
network_acronym_str UDEA2
network_name_str Repositorio UdeA
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Caracterización molecular del gen supresor de tumores TP53 en el cáncer colorrectal
dc.title.translated.spa.fl_str_mv Molecular characterization of TP53 tumor suppressor gene in colorectal cancer
title Caracterización molecular del gen supresor de tumores TP53 en el cáncer colorrectal
spellingShingle Caracterización molecular del gen supresor de tumores TP53 en el cáncer colorrectal
Neoplasias Colorrectales
Colorectal Neoplasms
Genes p53
Genes, p53
Heterogeneidad Genética
Genetic Heterogeneity
Carcinogénesis
Carcinogenesis
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D015179
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016158
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D018740
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D063646
title_short Caracterización molecular del gen supresor de tumores TP53 en el cáncer colorrectal
title_full Caracterización molecular del gen supresor de tumores TP53 en el cáncer colorrectal
title_fullStr Caracterización molecular del gen supresor de tumores TP53 en el cáncer colorrectal
title_full_unstemmed Caracterización molecular del gen supresor de tumores TP53 en el cáncer colorrectal
title_sort Caracterización molecular del gen supresor de tumores TP53 en el cáncer colorrectal
dc.creator.fl_str_mv Palacio Rúa, Katherine Andrea
Ceballos García, Hamilton Alfonso
Ahumada Rodríguez, Enoc Jesús
Isaza Jiménez, Luis Fernando
Muñetón Peña, Carlos Mario
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Palacio Rúa, Katherine Andrea
Ceballos García, Hamilton Alfonso
Ahumada Rodríguez, Enoc Jesús
Isaza Jiménez, Luis Fernando
Muñetón Peña, Carlos Mario
dc.contributor.researchgroup.spa.fl_str_mv Genética Médica
dc.subject.decs.none.fl_str_mv Neoplasias Colorrectales
Colorectal Neoplasms
Genes p53
Genes, p53
Heterogeneidad Genética
Genetic Heterogeneity
Carcinogénesis
Carcinogenesis
topic Neoplasias Colorrectales
Colorectal Neoplasms
Genes p53
Genes, p53
Heterogeneidad Genética
Genetic Heterogeneity
Carcinogénesis
Carcinogenesis
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D015179
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016158
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D018740
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D063646
dc.subject.meshuri.none.fl_str_mv https://id.nlm.nih.gov/mesh/D015179
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016158
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D018740
https://id.nlm.nih.gov/mesh/D063646
description RESUMEN: Introducción: El cáncer colorrectal (CCR) es una de las neoplasias más comunes en el mundo; especialmente, en los países desarrollados. En Colombia, la incidencia del CCR ocupa el cuarto lugar en hombres y mujeres; el CCR tiene una gran heterogeneidad genética. Objetivo: Determinar la presencia de mutaciones en los exones 5-8 del gen TP53 en tumores colorrectales, mediante el secuenciamiento directo. Métodos: Muestras con diagnóstico histopatológico de CCR esporádico se dividieron en dos grupos. El Grupo I fue de 30 muestras de tumores a partir de biopsias frescas, y el Grupo II, de 46 muestras de tejidos tumorales embebidos en bloques de parafina. El análisis de mutaciones se realizó en los exones 5-8 del gen TP53, empleando las técnicas de PCR y de secuenciamiento directo. Resultados: Se encontró una baja frecuencia de mutaciones en el gen TP53, del 4,4%; las mutaciones detectadas fueron sin sentido; además, fueron identificados dos polimorfismos que segregan juntos. Todas las mutaciones y los polimorfismos se detectaron en las muestras del grupo I. La mayoría de las muestras analizadas se hallaban en un estado avanzado del cáncer. Conclusiones: La baja frecuencia obtenida de mutaciones en TP53 permite sugerir la existencia de alteraciones en otras vías genéticas, relacionadas con la carcinogénesis colorrectal, como las vías de MSI y de CIN, así como la epigenética; dichas alteraciones no podrían excluirse en las muestras evaluadas. Los estudios moleculares en muestras de tejidos embebidos en parafina presentan dificultades para los análisis genéticos. La caracterización molecular del CCR es importante para conocer el espectro de mutaciones y de variantes moleculares presentes en la población observada
publishDate 2013
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2013
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2024-03-25T14:26:49Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2024-03-25T14:26:49Z
dc.type.spa.fl_str_mv Artículo de investigación
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv https://purl.org/redcol/resource_type/ART
dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
status_str publishedVersion
dc.identifier.issn.none.fl_str_mv 0120-9957
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/10495/38723
dc.identifier.eissn.none.fl_str_mv 2500-7440
identifier_str_mv 0120-9957
2500-7440
url https://hdl.handle.net/10495/38723
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartofjournalabbrev.spa.fl_str_mv Rev. Colomb. Gastroenterol.
dc.relation.citationendpage.spa.fl_str_mv 300
dc.relation.citationissue.spa.fl_str_mv 4
dc.relation.citationstartpage.spa.fl_str_mv 294
dc.relation.citationvolume.spa.fl_str_mv 28
dc.relation.ispartofjournal.spa.fl_str_mv Revista Colombiana de Gastroenterología
dc.rights.uri.*.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.extent.spa.fl_str_mv 7 páginas
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Asociación Colombiana de Gastroenterología
dc.publisher.place.spa.fl_str_mv Bogotá, Colombia
institution Universidad de Antioquia
bitstream.url.fl_str_mv https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/e79f1b3d-d8a4-4413-a428-c83fe6a70db9/download
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/0e50094c-1595-476d-a556-6e7355b7748f/download
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/6c9e91be-2a0f-4b5c-88b7-3abe13b26b90/download
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/4f83c96a-d306-410a-9b30-b3d37afb7877/download
https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/fbd28443-5f04-4bda-a30f-05a1c4f52881/download
bitstream.checksum.fl_str_mv 31c94ce8f8eb67bcb2dee463b3730d0a
b88b088d9957e670ce3b3fbe2eedbc13
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
44c296ffadfa34c86ce4e5533bbacba3
b0940c1f32ca84d3443d42a41aea0493
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional de la Universidad de Antioquia
repository.mail.fl_str_mv aplicacionbibliotecadigitalbiblioteca@udea.edu.co
_version_ 1851052442828931072
spelling Palacio Rúa, Katherine AndreaCeballos García, Hamilton AlfonsoAhumada Rodríguez, Enoc JesúsIsaza Jiménez, Luis FernandoMuñetón Peña, Carlos MarioGenética Médica2024-03-25T14:26:49Z2024-03-25T14:26:49Z20130120-9957https://hdl.handle.net/10495/387232500-7440RESUMEN: Introducción: El cáncer colorrectal (CCR) es una de las neoplasias más comunes en el mundo; especialmente, en los países desarrollados. En Colombia, la incidencia del CCR ocupa el cuarto lugar en hombres y mujeres; el CCR tiene una gran heterogeneidad genética. Objetivo: Determinar la presencia de mutaciones en los exones 5-8 del gen TP53 en tumores colorrectales, mediante el secuenciamiento directo. Métodos: Muestras con diagnóstico histopatológico de CCR esporádico se dividieron en dos grupos. El Grupo I fue de 30 muestras de tumores a partir de biopsias frescas, y el Grupo II, de 46 muestras de tejidos tumorales embebidos en bloques de parafina. El análisis de mutaciones se realizó en los exones 5-8 del gen TP53, empleando las técnicas de PCR y de secuenciamiento directo. Resultados: Se encontró una baja frecuencia de mutaciones en el gen TP53, del 4,4%; las mutaciones detectadas fueron sin sentido; además, fueron identificados dos polimorfismos que segregan juntos. Todas las mutaciones y los polimorfismos se detectaron en las muestras del grupo I. La mayoría de las muestras analizadas se hallaban en un estado avanzado del cáncer. Conclusiones: La baja frecuencia obtenida de mutaciones en TP53 permite sugerir la existencia de alteraciones en otras vías genéticas, relacionadas con la carcinogénesis colorrectal, como las vías de MSI y de CIN, así como la epigenética; dichas alteraciones no podrían excluirse en las muestras evaluadas. Los estudios moleculares en muestras de tejidos embebidos en parafina presentan dificultades para los análisis genéticos. La caracterización molecular del CCR es importante para conocer el espectro de mutaciones y de variantes moleculares presentes en la población observadaABSTRACT: Introduction: Colorectal cancer (CRC) is one of the most common malignancies in the world, especially in developed countries. In Colombia, the incidence of CRC ranks fourth in men and women. CRC has great genetic heterogeneity. Purpose: The purpose of this study was to determine the presence of mutations in exons 5 to 8 of the TP53 gene in colorectal tumors by direct sequencing. Patients and Methods: Samples with histopathological diagnoses of sporadic CRC were divided into two groups. Group I included 30 tumor samples from fresh biopsies and Group II included 46 tumor tissue samples embedded in paraffin blocks. Mutational analysis was performed for exons 5 through 8 of the TP53 gene using PCR and direct sequencing. Results: The frequency of TP53 mutations was only 4.4%, and mutations that were detected were nonsense mutations. In addition, two polymorphisms that segregate together were identified. All mutations and polymorphisms were detected in samples from Group I. Most of the samples were in advanced stages of cancer. Conclusions: The low frequency of mutations in TP53 suggests the existence of alterations on other related genetic pathways in colorectal carcinogenesis. These could include MSI pathways, CIN and epigenetics. Such alterations could not be excluded in the samples tested. Molecular studies of tissue samples embedded in paraffin are difficult to analyze genetically. Molecular characterization of CRC is important for determining the spectrum of mutations and molecular variants present in our population.COL00067327 páginasapplication/pdfspaAsociación Colombiana de GastroenterologíaBogotá, Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Caracterización molecular del gen supresor de tumores TP53 en el cáncer colorrectalMolecular characterization of TP53 tumor suppressor gene in colorectal cancerArtículo de investigaciónhttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1https://purl.org/redcol/resource_type/ARThttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionNeoplasias ColorrectalesColorectal NeoplasmsGenes p53Genes, p53Heterogeneidad GenéticaGenetic HeterogeneityCarcinogénesisCarcinogenesishttps://id.nlm.nih.gov/mesh/D015179https://id.nlm.nih.gov/mesh/D016158https://id.nlm.nih.gov/mesh/D018740https://id.nlm.nih.gov/mesh/D063646Rev. Colomb. Gastroenterol.300429428Revista Colombiana de GastroenterologíaPublicationORIGINALPalacioKatherine_2013_TP53CancerColorrectal.pdfPalacioKatherine_2013_TP53CancerColorrectal.pdfArtículo de investigaciónapplication/pdf235266https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/e79f1b3d-d8a4-4413-a428-c83fe6a70db9/download31c94ce8f8eb67bcb2dee463b3730d0aMD51trueAnonymousREADCC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8823https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/0e50094c-1595-476d-a556-6e7355b7748f/downloadb88b088d9957e670ce3b3fbe2eedbc13MD52falseAnonymousREADLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/6c9e91be-2a0f-4b5c-88b7-3abe13b26b90/download8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD53falseAnonymousREADTEXTPalacioKatherine_2013_TP53CancerColorrectal.pdf.txtPalacioKatherine_2013_TP53CancerColorrectal.pdf.txtExtracted texttext/plain33733https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/4f83c96a-d306-410a-9b30-b3d37afb7877/download44c296ffadfa34c86ce4e5533bbacba3MD54falseAnonymousREADTHUMBNAILPalacioKatherine_2013_TP53CancerColorrectal.pdf.jpgPalacioKatherine_2013_TP53CancerColorrectal.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg13324https://bibliotecadigital.udea.edu.co/bitstreams/fbd28443-5f04-4bda-a30f-05a1c4f52881/downloadb0940c1f32ca84d3443d42a41aea0493MD55falseAnonymousREAD10495/38723oai:bibliotecadigital.udea.edu.co:10495/387232025-03-26 22:26:09.661http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/open.accesshttps://bibliotecadigital.udea.edu.coRepositorio Institucional de la Universidad de Antioquiaaplicacionbibliotecadigitalbiblioteca@udea.edu.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