Variabilidad genética de Pintomyia evansi en el departamento de Córdoba mediante Citocromo Oxidasa I – Código de barras.
Objetivo. Determinar la variabilidad genética de Pintomyia evansi en localidades del departamento de Córdoba con base en el gen Citocromo Oxidasa I (COI) como marcador molecular de la especie. Materiales y métodos. Se realizaron recolecciones entomológicas en las localidades de Galilea, Puerto Anchi...
- Autores:
-
Bohórquez Hernández, Dayana Marcela
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Universidad de Córdoba
- Repositorio:
- Repositorio Institucional Unicórdoba
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- https://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/2260
- Palabra clave:
- Pintomyia evansi
Variabilidad genética
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Pintomyia evansi
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Objetivo. Determinar la variabilidad genética de Pintomyia evansi en localidades del departamento de Córdoba con base en el gen Citocromo Oxidasa I (COI) como marcador molecular de la especie. Materiales y métodos. Se realizaron recolecciones entomológicas en las localidades de Galilea, Puerto Anchica, Centro Alegre, Pica Pica Viejo, Nuevo Oriente y Zaino del departamento de Córdoba. Se utilizó como marcador genético la región de código de barras de ADN del gen mitocondrial Citocromo Oxidasa I. El análisis genético incluyó parámetros de diversidad genética, la prueba D de neutralidad Tajima, estructura genética, flujo génico y relaciones filogenéticas. Resultados. Se obtuvieron 37 secuencias a partir de las muestras en el departamento de Córdoba y 4 secuencias de Sucre (GenBank), para un total de 41 secuencias con un tamaño de 556 nucleótidos del gen COI. La resultados de la prueba D de Tajima fueron negativos y no significativos (p>0,10). Los valores de distancias genéticas entre poblaciones fueron bajas con un rango de 0,00636 – 0,01191, con valores de variabilidad intraespecifica <3%. Los estimadores de estructura génica y flujo de genes Nm (1.74 – 574.21) evidenciaron que no hubo diferenciación genética en las poblaciones muestreadas debido al alto flujo de migrantes. El árbol filogenético de inferencia bayesiana muestra una sola especie sin diferenciación de linajes en el rango geográfico estudiado. Conclusión. Las poblaciones estudiadas de Pi. evansi en Córdoba y sucre, aparecieron homogéneas entre sí, indicando que las poblaciones están en un intercambio constante de migrantes. |
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1. Bejarano EE, Rojas W, Uribe S, Vélez ID, Porter C. Variabilidad genética en Lutzomyia (verrucarum) evansi (Núñez-Tovar, 1924), vector de Leishmaniosis visceral americana. Iatreia [Internet]. 2001;14(4):2001. Available from: https://aprendeenlinea.udea.edu.co/revistas/index.php/iatreia/article/view/3853 2. Maia-Elkhoury AN, Branco Valadas SY, Nicholls S, Puppim Buzanovsky L. LEISHMANIASIS Informe Epidemiológico de las Américas [Internet]. Washington; 2019. Available from: www.paho.org/leishmaniasis 3. Cortés LA, Fernández JJ. Especies de Lutzomyia en un foco urbano de leishmaniasis visceral y cutánea en El Carmen de Bolívar, Bolívar, Colombia Luis. Biomedica [Internet]. 2008;28:433–40. Available from: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19034365 4. Bejarano EE, Uribe S, Rojas W, Vélez ID. Phlebotomine sand flies (Diptera: Psychodidae) associated with the appearance of urban leishmaniasis in the City of Sincelejo, Colombia. Mem Inst Oswaldo Cruz [Internet]. 12 2002;97(5):645–7. Available from: http://www.scielo.br/pdf/mioc/v97n5/4479.pdf 5. Walsh JF, Molyneuxf DH, Birley MH. Deforestation: effects on vector-borne disease. Parasitology. 1993;106:55–75. 6. Ferro C, López M, Fuya P, Lugo L, Cordovez JM, González C. Spatial distribution of sand fly vectors and eco-epidemiology of cutaneous leishmaniasis transmission in Colombia. PLoS One. 2015;10(10):1–16. 7. González C, Cabrera OL, Munstermann LE, Ferro C. Distribución de los vectores de Leishmania infantum (Kinetoplastida: Trypanosomatidae) en Colombia. Biomédica. 2006;26(1):64–72. 8. Hajibabaei M, Singer GAC, Clare EL, Hebert PDN. Design and applicability of DNA arrays and DNA barcodes in biodiversity monitoring. BMC Biol. 2007;5:1–7. 9. Young DG, Duncan MA. Guide to the identification and geographic distribution of Lutzomyia sand flies in Mexico, the west indies, central and south America (Diptera: Psychodidae). Gainesville, Florida: Associated Publishers; 1994. 10. Hoyos L R, Uribe S S, Vélez I. Tipificación de especímenes colombianos de lutzomyia longipalpis (diptera: Psychodidae) mediante “código de barras.” Rev Colomb Entomol. 2012;38(1):134–40. 11. Hebert PDN, Cywinska A, Ball SL, DeWaard JR. Biological identifications through DNA barcodes. Proc R Soc B Biol Sci. 2003;270(1512):313–21. 12. Hall TA. BioEdit: user friendly biological sequence alignment editor 95/98/NT. Nucleic Acids Symp [Internet]. 1999;41:95–8. Available from: http://brownlab.mbio.ncsu.edu/JWB/papers/1999Hall1.pdf 13. Librado P, Rozas J. DnaSP v5: A software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Bioinformatics. 2009;25(11):1451–2. 14. Contreras Gutiérrez MA, Vivero RJ, Vélez ID, Porter CH, Uribe S. DNA barcoding for the 13 identification of sand fly species (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) in Colombia. PLoS One. 2014;9(1). 15. Lanteri AA, Loiácono MS, Margaría C. Aportes de la biología molecular a la conservación de los insectos [Internet]. Vol. 2, Monografías Tercer Milenio. 2002. Available from: http://www.sea-entomologia.org/PDF/M3M_PRIBES_2002/207_220_Lanteri.pdf 16. Hebert PDN, Ratnasingham S, R deWaard J. Barcoding animal life : cytochrome c oxidase subunit 1 divergences among closely related species Barcoding animal life : cytochrome c oxidase subunit 1 divergences among closely related species. R Soc. 2003;(figure 1):96–9. 17. Bejarano EE, Rojas W, Uribe S, Vélez ID, Porter CH. Genetic analysis of a recently detected urban population of Lutzomyia evansi (Diptera: Psychodidae) in Colombia. Rev la Soc Entomol Argentina [Internet]. 2009;68(1–2):135–41. Available from: https://www.biotaxa.org/RSEA/article/view/29996 18. Bejarano EE, Rojas W, Uribe S, Vélez ID. Sistemática de especies de Lutzomyia del grupo verrucarum Theodor, 1965 (Diptera: Psychodiadae). Biomédica. 2003;23(1):87. 19. Rosero-Galindo CY, Montenegro Coral FA, García López JP. Marcadores moleculares como herramientas en la identificación y análisis genético de especies vectores de interés en salud pública, género Lutzomyia (Grupo Verrucarum Theodor, 1965). Univ y Salud. 2016;18(1):138–55. 20. Carrero-Sarmiento D, Hoyos-López R. Molecular identification and genetic diversity of lutzomyia gomezi (Diptera: Psychodidae) using DNA-barcodes in Cordoba, Colombia. Trop Biomed [Internet]. 2018;35(1):100–10. Available from: https://www.researchgate.net/profile/Richard_Hoyos/publication/323839829_Molecular_identification_and_genetic_diversity_of_Lutzomyia_gomezi_Diptera_Psychodidae_using_DNA-barcodes_in_Cordoba_Colombia/links/5aafb7daaca2721710fcd82d/Molecular-identification- 21. Atencia-Pineda M, Toro-Cantillo A, Hoyos-López R. Diversidad genética y estructura poblacional de Anopheles triannulatus s.l. en Córdoba, Colombia, determinadas mediante el método de región de código de barras de ADN. Biomédica. 2018;38:117–26. 22. Toro-Cantillo A, Hoyos-López R. Molecular identification of deinocerites atlanticus (Adames, 1971) (diptera: Culicidae) using cytochrome oxidase I. J Vector Borne Dis. 2018;55(1):63–5. |
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El análisis genético incluyó parámetros de diversidad genética, la prueba D de neutralidad Tajima, estructura genética, flujo génico y relaciones filogenéticas. Resultados. Se obtuvieron 37 secuencias a partir de las muestras en el departamento de Córdoba y 4 secuencias de Sucre (GenBank), para un total de 41 secuencias con un tamaño de 556 nucleótidos del gen COI. La resultados de la prueba D de Tajima fueron negativos y no significativos (p>0,10). Los valores de distancias genéticas entre poblaciones fueron bajas con un rango de 0,00636 – 0,01191, con valores de variabilidad intraespecifica <3%. Los estimadores de estructura génica y flujo de genes Nm (1.74 – 574.21) evidenciaron que no hubo diferenciación genética en las poblaciones muestreadas debido al alto flujo de migrantes. El árbol filogenético de inferencia bayesiana muestra una sola especie sin diferenciación de linajes en el rango geográfico estudiado. Conclusión. Las poblaciones estudiadas de Pi. evansi en Córdoba y sucre, aparecieron homogéneas entre sí, indicando que las poblaciones están en un intercambio constante de migrantes.Resumen.....................................................................................................................1Introducción................................................................................................................2Materiales y Métodos..........................................................................................2Resultados................................................................................................................4Discusión.................................................................................................................9Conclusión...........................................................................................................11Agradecimientos.................................................................................................11Conflicto de Interés..........................................................................................11Referencias............................................................................................................11ArticuloPregradoBacteriólogo(a)application/pdfspaCopyright Universidad de Córdoba, 2020https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/restrictedAccessAtribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_16ecVariabilidad genética de Pintomyia evansi en el departamento de Córdoba mediante Citocromo Oxidasa I – Código de barras.Artículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1info:eu-repo/semantics/publishedVersionTexthttps://purl.org/redcol/resource_type/ARThttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a851. Bejarano EE, Rojas W, Uribe S, Vélez ID, Porter C. Variabilidad genética en Lutzomyia (verrucarum) evansi (Núñez-Tovar, 1924), vector de Leishmaniosis visceral americana. Iatreia [Internet]. 2001;14(4):2001. Available from: https://aprendeenlinea.udea.edu.co/revistas/index.php/iatreia/article/view/38532. Maia-Elkhoury AN, Branco Valadas SY, Nicholls S, Puppim Buzanovsky L. LEISHMANIASIS Informe Epidemiológico de las Américas [Internet]. Washington; 2019. Available from: www.paho.org/leishmaniasis3. Cortés LA, Fernández JJ. Especies de Lutzomyia en un foco urbano de leishmaniasis visceral y cutánea en El Carmen de Bolívar, Bolívar, Colombia Luis. Biomedica [Internet]. 2008;28:433–40. Available from: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/190343654. Bejarano EE, Uribe S, Rojas W, Vélez ID. Phlebotomine sand flies (Diptera: Psychodidae) associated with the appearance of urban leishmaniasis in the City of Sincelejo, Colombia. Mem Inst Oswaldo Cruz [Internet]. 12 2002;97(5):645–7. 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Molecular identification of deinocerites atlanticus (Adames, 1971) (diptera: Culicidae) using cytochrome oxidase I. J Vector Borne Dis. 2018;55(1):63–5.Pintomyia evansiVariabilidad genéticaCitocromo Oxidasa Iflujo génicoestructura genéticaPintomyia evansiGenetic variabilityCytochrome Oxidase Igene flowgenetic structureFacultad de Ciencias de la SaludBacteriologíaPublicationORIGINALBohorquez Hernandez Dayana Marcela.pdfBohorquez Hernandez Dayana Marcela.pdfapplication/pdf740567https://repositorio.unicordoba.edu.co/bitstreams/f2a2f70f-0fd7-4519-9b6f-28530d316f42/download36d1863336936b9d5f4613133a65519aMD51Formato de Autorizacion.pdfFormato de Autorizacion.pdfapplication/pdf1084281https://repositorio.unicordoba.edu.co/bitstreams/6b2c22cb-c447-46ad-ba4b-65f8023b28f5/download3ee621cf28921a6d88d04c86c9e77a24MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-814828https://repositorio.unicordoba.edu.co/bitstreams/a1ecf4d0-06a8-4647-9305-551a01208d41/download2f9959eaf5b71fae44bbf9ec84150c7aMD53TEXTBohorquez Hernandez Dayana Marcela.pdf.txtBohorquez Hernandez Dayana Marcela.pdf.txtExtracted 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