Presencia de SARS-CoV-2 en un grupo de animales de fauna silvestre bajo el cuidado humano en tres centros ex situ del departamento de Córdoba
Introducción. Es claro que el origen del SARS-CoV-2 es zoonótico‚ la presencia del virus ha sido reportada en animales domésticos‚ cautivos y de vida silvestre en el mundo. A medida que ocurren contagios a nuevos hospederos animales de esta enfermedad emergente se podría dirigir a la evolución de nu...
- Autores:
-
Paternina Huertas, Esteban Andrés
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2023
- Institución:
- Universidad de Córdoba
- Repositorio:
- Repositorio Institucional Unicórdoba
- Idioma:
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- OAI Identifier:
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- Acceso en línea:
- https://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/7652
- Palabra clave:
- COVID 19
Mutación
Factores de riesgo
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ACE2
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Introducción. Es claro que el origen del SARS-CoV-2 es zoonótico‚ la presencia del virus ha sido reportada en animales domésticos‚ cautivos y de vida silvestre en el mundo. A medida que ocurren contagios a nuevos hospederos animales de esta enfermedad emergente se podría dirigir a la evolución de nuevas variantes. Las consecuencias para la salud pública nos orientan a desarrollar estrategias y tener un enfoque de “una sola salud” para estudiar los nuevos ciclos epidemiológicos a los que se adapte el virus. Objetivo. Establecer la presencia de SARS-CoV-2 en un grupo de animales de fauna silvestre bajo el cuidado humano en tres centros ex situ del departamento de Córdoba. Métodos. Se realizó un estudio que incluyó especies de animales silvestres en cautiverio dentro de los órdenes: cérvidos‚ canidos salvajes‚ felinos‚ mustélidos y primates no humanos‚ pertenecientes a tres centros Ex situ en Córdoba. Se realizó un muestreo por conveniencia entre octubre de 2021 hasta febrero de 2023. Se tomaron muestras de hisopado nasal‚ oral‚ sangre total y suero. Los hisopados fueron sometidos a extracción de ARN con GeneJET RNA Purification Kit (Thermo Scientific™‚ Ref: 0732). Para la detección molecular de SARS-CoV-2 se realizó una RT-qPCR para detección de los genes E y N. Para la detección de anticuerpos totales específicos a la proteína N del virus SARS-CoV-2 se realizó una ELISA comercial ID Screen® SARS-CoV-2- Double Antigen Multi-species‚ (ID.Vet). Resultados. Se recolectaron muestras de 35 animales silvestres en cautiverio. La RT-qPCR detectó un animal positivo un perezoso didáctilo (Choloepus hoffmanni) 2,85% (1/35). En cuanto a la prueba serológica‚ un 2,85% (1/35) tigrillo (Leopardus tigrinus) resultó positivo para la detección de anticuerpos totales contra la proteína N del virus. Conclusiones. El porcentaje de infección obtenido fue del 5,7%‚ es posible que el bajo número de infectados en el presente estudio se deba al periodo epidemiológico en el cual los casos en humanos ya estaban en descenso. |
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Tique Salleg, Vaneza Paulin9b5faa35-b784-407d-ad3f-90bcd451425e-1Mattar Velilla, Salime905313b-2584-4269-bfdb-58d23418144a-1Carrascal Velásquez, Juan Carlos7cc4e502-fe5d-4081-9e28-e438f9008503-1Paternina Huertas, Esteban Andrése34b9778-f792-4e08-a39d-18160c3d70ca-12023-08-15T20:25:03Z2024-08-152023-08-15T20:25:03Z2023-08-15https://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/7652Introducción. Es claro que el origen del SARS-CoV-2 es zoonótico‚ la presencia del virus ha sido reportada en animales domésticos‚ cautivos y de vida silvestre en el mundo. A medida que ocurren contagios a nuevos hospederos animales de esta enfermedad emergente se podría dirigir a la evolución de nuevas variantes. Las consecuencias para la salud pública nos orientan a desarrollar estrategias y tener un enfoque de “una sola salud” para estudiar los nuevos ciclos epidemiológicos a los que se adapte el virus. Objetivo. Establecer la presencia de SARS-CoV-2 en un grupo de animales de fauna silvestre bajo el cuidado humano en tres centros ex situ del departamento de Córdoba. Métodos. Se realizó un estudio que incluyó especies de animales silvestres en cautiverio dentro de los órdenes: cérvidos‚ canidos salvajes‚ felinos‚ mustélidos y primates no humanos‚ pertenecientes a tres centros Ex situ en Córdoba. Se realizó un muestreo por conveniencia entre octubre de 2021 hasta febrero de 2023. Se tomaron muestras de hisopado nasal‚ oral‚ sangre total y suero. Los hisopados fueron sometidos a extracción de ARN con GeneJET RNA Purification Kit (Thermo Scientific™‚ Ref: 0732). Para la detección molecular de SARS-CoV-2 se realizó una RT-qPCR para detección de los genes E y N. Para la detección de anticuerpos totales específicos a la proteína N del virus SARS-CoV-2 se realizó una ELISA comercial ID Screen® SARS-CoV-2- Double Antigen Multi-species‚ (ID.Vet). Resultados. Se recolectaron muestras de 35 animales silvestres en cautiverio. La RT-qPCR detectó un animal positivo un perezoso didáctilo (Choloepus hoffmanni) 2,85% (1/35). En cuanto a la prueba serológica‚ un 2,85% (1/35) tigrillo (Leopardus tigrinus) resultó positivo para la detección de anticuerpos totales contra la proteína N del virus. Conclusiones. El porcentaje de infección obtenido fue del 5,7%‚ es posible que el bajo número de infectados en el presente estudio se deba al periodo epidemiológico en el cual los casos en humanos ya estaban en descenso.LISTA DE TABLAS 9LISTA DE FIGURAS 10RESUMEN 12ABSTRACT 141. INTRODUCCIÓN 152. OBJETIVOS 182.1. GENERAL 182.2. ESPECÍFICOS 183. MARCO TEORICO 193.1. TAXONOMÍA 193.2. GENOMA 193.3. ORIGEN Y TRANSMISIÓN 203.4. EPIDEMIOLOGÍA EN LA FAUNA SILVESTRE 233.5. PRESENTACIÓN CLÍNICA 273.6. FISIOPATOLOGÍA Y REPLICACIÓN 293.7. FACTORES DE RIESGO 313.8. MANEJO Y TIPOS DE RESTRICCION ANIMAL 333.8.1. Restricción física 333.8.2. Restricción química 343.8.3. Monitoreo de signos y manejo médico 343.9. DIAGNÓSTICO 353.9.1. Diagnóstico molecular 353.9.2. Diagnóstico serológico 353.9.3. Seroneutralización 363.9.4. Secuenciación 364. DISEÑO METODOLÓGICO 384.1. TIPO DE ESTUDIO 384.2. TIPO DE MUESTREO Y CÁLCULO DEL TAMAÑO DE LA MUESTRA 384.3. LOCALIZACIÓN DEL ESTUDIO 394.4. POBLACIÓN DEL ESTUDIO 394.5. PROCEDIMIENTOS PARA LA RECOLECCIÓN DE INFORMACIÓN 404.6. PLAN PARA LA TABULACIÓN Y ANÁLISIS DE DATOS 404.7. PROCEDIMIENTOS DE TOMA DE MUESTRAS CLÍNICAS 414.7.1. Hisopado nasal y oral: 424.7.2. Sangre: 424.7.3. Conservación de las muestras y transporte 434.8. PRUEBA SEROLÓGICA 434.8.1. Técnicas de ELISA 434.9. PRUEBAS MOLECULARES 464.9.1. RT-qPCR multiplex para detección de los genes E y N de SARS-CoV-2 474.9.2. Interpretación de resultados 494.9.3. Secuenciación de muestras 505. ASPECTOS ÉTICOS Y LEGISTALIVOS 516. RESULTADOS 526.1. DESCRIPCIÓN DE LA POBLACIÓN: 526.2. ANIMALES POSITIVOS POR PRUEBA SEROLÓGICA Y MOLECULAR 546.2.1. Felino (Leopardus tigrinus). 546.2.2. Perezoso didactilo (Choloepus hofftmanni) 556.3. RESULTADO DE SECUENCIACIÓN 566.4. DESCRIPCIÓN DE CARACTERISTICAS RELACIONADAS CON LA ATENCION DE LOS ANIMALES 577. DISCUSIÓN 598. CONCLUSIONES 639. RECOMENDACIONES 6410. ASPECTOS ADMINISTRATIVOS 6511. BIBLIOGRAFÍA 66ANEXOS 73PregradoMédico(a) Veterinario(a) y ZootecniaTrabajos de Investigación y/o Extensiónapplication/pdfspaUniversidad de CórdobaFacultad de Medicina Veterinaria y ZootecniaBerástegui, Córdoba, ColombiaMedicina Veterinaria y ZootecniaCopyright Universidad de Córdoba, 2023https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/embargoedAccessAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_f1cfPresencia de SARS-CoV-2 en un grupo de animales de fauna silvestre bajo el cuidado humano en tres centros ex situ del departamento de CórdobaTrabajo de grado - Pregradoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTexthttp://purl.org/coar/version/c_71e4c1898caa6e32COVID 19MutaciónFactores de riesgoZooantroponosisACE2COVID 19MutationRisk factorsZooanthroponosisACE2(1) Singla R, Mishra A, Joshi R, Jha S, Sharma AR, Upadhyay S, et al. 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