Estructura genética del capitán de la Sabana en tres regiones hidrográficas Modalidad Investigación

RESTRICCION PERMANENTE. El pez Capitán de la Sabana (Eremophilus mutisii) es una especie endémica del altiplano cundiboyacense en peligro de extinción. Por lo tanto, es necesario estudiar su estructura y variabilidad genética para la conservación y supervivencia de la especie a largo plazo. El prese...

Full description

Autores:
Pedroza Silva, Laura Sofía
Higuera Mora, Lina Gabriela
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2025
Institución:
Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A
Repositorio:
Repositorio Institucional UDCA
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.udca.edu.co:11158/6694
Acceso en línea:
https://repository.udca.edu.co/handle/11158/6694
https://repository.udca.edu.co/
Palabra clave:
630 - Agricultura y tecnologías relacionadas::636 - Producción animal
Capitán de la Sabana
Genética animal
Eremophilus mutisii
Especie amenazada
Pez de agua dulce
Variación genética
Rights
openAccess
License
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/legalcode.es
Description
Summary:RESTRICCION PERMANENTE. El pez Capitán de la Sabana (Eremophilus mutisii) es una especie endémica del altiplano cundiboyacense en peligro de extinción. Por lo tanto, es necesario estudiar su estructura y variabilidad genética para la conservación y supervivencia de la especie a largo plazo. El presente estudio tuvo como objetivo evaluar la diversidad genética de tres regiones hidrográficas del pez Capitán de la Sabana utilizando marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) obtenidos por medio de la metodología RAD-seq. En total fueron utilizados 95 peces provenientes del embalse de Sisga (33), la laguna de Suesca (33) y la laguna de Fúquene (29). De cada individuo se extrajo ADN utilizando kit Monarch gDNA Purification, el cual fue enviado para secuenciación por RAD-seq, a través de la plataforma Illumina. A partir de los resultados de secuenciación se estimaron los parámetros del alelo menos común (MAF), Equilibrio Hardy Weinberg (EHW), coeficiente de endogamia (FIS) y prueba G, por medio del software Genepop 4.2.8. Adicionalmente, se realizó un análisis de componentes principales mediante la librería FactoMineR incluida en el software R. De los SNPs obtenidos para cada población 13786 (Fúquene), 14312 (Suesca) y 14341 (Sisga), se encontraron en EHW, además, los valores MAF entre 0 y 0.05 presentaron una mayor cantidad de SNPs, 5508 (Fúquene), 6409 (Sisga) y 6508 (Suesca). En las tres regiones hidrográficas se detectó endogamia con valores de FIS de 0.138 (Suesca), 0.145 (Sisga), y 0.160 (Fúquene), evidenciando una variabilidad genética moderada. Además, no se observó diferencia estadística significativa (p > 0.05) en las frecuencias genotípicas entre los individuos de las tres poblaciones. Lo anterior se visualizó gracias al ACP al formarse tres grupos genéticos con mezcla de las tres regiones hidrográficas, sugiriendo procesos de conexión hídrica y traslados que favorecieron el flujo genético.