Reconocimiento de patrones en el uso de codones de tres virus aviares y 3 hospederos naturales C. japonica, G. gallus y M. gallopavo.

RESTRICCION NOV.2026. Las enfermedades aviares de origen respiratorio representan una importante amenaza para la industria avícola, debido a que no solo afecta la salud del animal sino que también repercute en su productividad, entre los agentes que forman parte de este complejo respiratorio se encuentra la influenza aviar (IAV), la bronquitis infecciosa aviar (IBV) y la enfermedad de Newcastle, lo que pretende este trabajo es analizar el mecanismo evolutivo que utilizan los virus para adaptarse a su entorno, junto con un análisis respectivo del uso de codones de los virus, compararlos con el uso de codones de los hospederos aviares, para eso se procesaron un total de 246 secuencias virales obtenidas de diferentes regiones geográficas junto el mRNA de los tejidos blanco de G. gallus, C. japonica y M. gallopavo, además de A. missisipiensis como control negativo. Tras el análisis de las secuencias se calcularon valores para el RSCU, CAI Y ENC, para realizar gráficos de dispersión, diagrama de cajas y bigotes y árboles filogenéticos. Los resultados mostraron que todos los valores se ubican por debajo de la curva, indicando así que la fuerza evolutiva que prevalece es la selección natural, del mismo modo, se observó una prevalencia por el uso del codón AGA para 4 de las 5 proteínas virales analizadas, a su vez, se entró que los hospederos que presentan mayor afinidad con las secuencias virales fueron G. gallus y M. gallopavo, por último, se concluye que algunos genes virales mostraron algunas señales de presión mutacional, estas no fueron suficientes para generar un patrón claro de cosegregación entre los hospederos y los virus.

• Autores: Polo Vásquez, Santiago
• Tipo de recurso: Trabajo de grado de pregrado
• Fecha de publicación: 2025
• Institución: Universidad de Ciencias Aplicadas y Ambientales U.D.C.A
• Repositorio: Repositorio Institucional UDCA
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repository.udca.edu.co:11158/6773
• Acceso en línea: https://repository.udca.edu.co/handle/11158/6773; https://repository.udca.edu.co/
• Palabra clave: 630 - Agricultura y tecnologías relacionadas::636 - Producción animal; Virus de la Enfermedad de Newcastle; Uso de Codones; Gripe Aviar; Selección Genética; Bronquitis aviar
• Rights: openAccess
• License: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/legalcode.es