Aplicación de métodos computacionales y experimentales para la identificación de compuestos con actividad antimicrobiana para el control de ralstonia solanacearum responsable de la marchitezbacteriana de la papa (solanum tuberosum)
Identificar un compuesto de origen natural en potencial actividad antimicrobiana contra Ralstonia solanacearum, patógeno que causa la marchitez bacteriana en la papa. En este sentido, se implementó una estrategia computacional con el propósito de identificar una diana terapéutica en la bacteria y po...
- Autores:
-
Pineda Caicedo, Yeini Colombia
Soto Blanco, Kelly Johana
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2024
- Institución:
- Universidad Francisco de Paula Santander
- Repositorio:
- Repositorio Digital UFPS
- Idioma:
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- OAI Identifier:
- oai:repositorio.ufps.edu.co:ufps/9810
- Acceso en línea:
- https://repositorio.ufps.edu.co/handle/ufps/9810
- Palabra clave:
- CADD (Diseño de drogas asistido por computadora)
Compuestos naturales
Antimicrobiana
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- openAccess
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Identificar un compuesto de origen natural en potencial actividad antimicrobiana contra Ralstonia solanacearum, patógeno que causa la marchitez bacteriana en la papa. En este sentido, se implementó una estrategia computacional con el propósito de identificar una diana terapéutica en la bacteria y posibles inhibidores derivados de bibliotecas de compuestos de origen natural. Secuentemente, se condujeron experimentos in vivo para evaluar capacidad de compuestos seleccionados en inhibir efectivamente la bacteria. |
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Rodas Mendoza, Elkin FernandoPineda Caicedo, Yeini ColombiaSoto Blanco, Kelly JohanaLópez Barrera, German LucianoGelvez Zambrano, German RicardoRodríguez Aguilar, Marlon Hans2025-09-08T16:37:45Z2025-09-08T16:37:45Z2024https://repositorio.ufps.edu.co/handle/ufps/9810Identificar un compuesto de origen natural en potencial actividad antimicrobiana contra Ralstonia solanacearum, patógeno que causa la marchitez bacteriana en la papa. En este sentido, se implementó una estrategia computacional con el propósito de identificar una diana terapéutica en la bacteria y posibles inhibidores derivados de bibliotecas de compuestos de origen natural. Secuentemente, se condujeron experimentos in vivo para evaluar capacidad de compuestos seleccionados en inhibir efectivamente la bacteria.Tabla de contenido pág. Resumen 14 Abstract 16 Introducción 18 1. Descripción del problema 21 Título 21 Planteamiento del problema 21 Formulación del problema 23 Objetivos 24 Objetivo General 24 Objetivos Específicos. 24 Justificación 24 Alcances y limitaciones 26 Alcances 26 Limitaciones 27 2. Marco referencial 29 Antecedentes 29 Marco teórico 32 Importancia de la papa 32 Marchitez bacteriana de la papa y Ralstonia solanacearum 32 Sintomatología de la marchitez bacteriana de la papa 34 Bioinformática y Diseño de Drogas Asistido por Computadora (CADD) 36 Marco conceptual 43 Marco contextual 46 Marco legal 46 3. Diseño metodológico 48 Tipo de investigación 48 Población y muestra 49 Población 49 Muestra 49 Identificación de genes esenciales en Ralstonia solanacearum 50 Determinación de homología entre dianas terapéuticas de R. solanacearum y proteínas presentes en el hombre, plantas hospederas e insectos polinizadores 51 Modelado y validación de estructura 3D de la diana terapéutica de R. solanacearum 52 Identificación del sitio catalítico de la proteína 54 Cribado Virtual 54 Dinámica molecular 56 Determinación de la actividad antimicrobiana del compuesto identificado a partir de ensayos de antibiograma. 57 4. Resultados y discusión 59 Identificación de genes que codifiquen proteínas esenciales para la supervivencia de la bacteria R. solanacearum. 59 Modelado y validación de la estructura tridimensional de la treonina sintasa de R. solanacearum 64 Identificación del sitio catalítico de la proteína treonina sintasa de R. solanacearum y sus coordenadas correspondientes 66 Cribado virtual y selección de candidatos para la inhibición de la treonina sintasa 68 5. Conclusiones 89 6. Recomendaciones 91 Referencias bibliográficas 93 Anexos 104PregradoIngeniero(a) Agrónomo(a)118 páginas. ilustraciones, (Trabajo completo) 2.495 KBapplication/pdfspaUniversidad Francisco de Paula SantanderFacultad de Ciencias Agrarias y del AmbienteSan José de CúcutaIngeniería AgronómicaDerechos Reservados - Universidad Francisco de Paula Santanderhttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2https://catalogobiblioteca.ufps.edu.co/cgi-bin/koha/opac-detail.pl?biblionumber=60607&query_desc=kw%2Cwrdl%3A%20TIAG%20V000Aplicación de métodos computacionales y experimentales para la identificación de compuestos con actividad antimicrobiana para el control de ralstonia solanacearum responsable de la marchitezbacteriana de la papa (solanum tuberosum)Trabajo de grado - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTextinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesishttps://purl.org/redcol/resource_type/TPinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85CADD (Diseño de drogas asistido por computadora)Compuestos naturalesAntimicrobianaRalstonia solanacearumtreonina sintasaCADD (Diseño de drogas asistido por computadora)Compuestos naturalesAbdul Raheem, A. 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