Caracterización morfométrica y molecular de poblaciones de Radopholus similis [(Cobb) Thorne (Rhabditida: Pratylenchidae)] en Colombia

Objetivo: Estudiar la variabilidad intraespecífica en diferentes poblaciones de Radopholus similis. Alcance: Poblaciones de R. similis provenientes principalmente del Bajo Occident e de Caldas, Colombia. Metodología: Se midieron 19 caracteres morfométricos y alométricos en hembras y machos de R. sim...

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Autores:
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2023
Institución:
Universidad de Caldas
Repositorio:
Repositorio Institucional U. Caldas
Idioma:
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OAI Identifier:
oai:repositorio.ucaldas.edu.co:ucaldas/23485
Acceso en línea:
https://repositorio.ucaldas.edu.co/handle/ucaldas/23485
https://doi.org/10.17151/bccm.2023.27.2.6
Palabra clave:
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description Objetivo: Estudiar la variabilidad intraespecífica en diferentes poblaciones de Radopholus similis. Alcance: Poblaciones de R. similis provenientes principalmente del Bajo Occident e de Caldas, Colombia. Metodología: Se midieron 19 caracteres morfométricos y alométricos en hembras y machos de R. similis recolectados en los municipios de Anserma, Belalcázar, Carepa y Palestina, los cuales fueron analizados mediante componentes principales y de conglomerados jerárquicos. Igualmente, se amplificó por PCR y se secuenció la región parcial ITS1-5.8S-ITS2 y el gen 18S del ARN ribosomal correspondiente a las poblaciones de R. similis antes mencionadas. Con estas secuencias, y 61 secuencias adicionales obtenidas de la base de datos del NCBI, se construyó una red haplotípica para detectar la variación genética de la especie. Resultados principales: La caracterización morfométrica mostró que las hembras de R. similis procedentes de Anserma y Belalcázar presentaron un esófago más alargado y las recolectadas de Palestina fueron más robustas en la región anterior al nivel de la base del estilete, con cuerpos y esófagos más alargados. El análisis molecular de la región ITS1-5.8S-ITS2 del ARN ribosomal no mostró variabilidad intraespecífica entre las poblaciones de R. similis estudiadas. Sin embargo, la red haplotípica construida en este estudio, junto con la recolectada de la base de datos del NCBI, reveló variabilidad intraespecífica entre las poblaciones de R. similis provenientes de África y del Sudeste Asiático. Conclusiones: No fue posible detectar variabilidad molecular entre las poblaciones de R. similis estudiadas. Sin embargo, sí se encontró variabilidad morfométrica entre las poblaciones de R. similis procedentes de Anserma, Belalcázar, Carepa y Palestina, Colombia.
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Boletín Científico Centro de Museos Museo de Historia Natural
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Núm. 2 , Año 2023 : Julio-Diciembre
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Igualmente, se amplificó por PCR y se secuenció la región parcial ITS1-5.8S-ITS2 y el gen 18S del ARN ribosomal correspondiente a las poblaciones de R. similis antes mencionadas. Con estas secuencias, y 61 secuencias adicionales obtenidas de la base de datos del NCBI, se construyó una red haplotípica para detectar la variación genética de la especie. Resultados principales: La caracterización morfométrica mostró que las hembras de R. similis procedentes de Anserma y Belalcázar presentaron un esófago más alargado y las recolectadas de Palestina fueron más robustas en la región anterior al nivel de la base del estilete, con cuerpos y esófagos más alargados. El análisis molecular de la región ITS1-5.8S-ITS2 del ARN ribosomal no mostró variabilidad intraespecífica entre las poblaciones de R. similis estudiadas. Sin embargo, la red haplotípica construida en este estudio, junto con la recolectada de la base de datos del NCBI, reveló variabilidad intraespecífica entre las poblaciones de R. similis provenientes de África y del Sudeste Asiático. Conclusiones: No fue posible detectar variabilidad molecular entre las poblaciones de R. similis estudiadas. Sin embargo, sí se encontró variabilidad morfométrica entre las poblaciones de R. similis procedentes de Anserma, Belalcázar, Carepa y Palestina, Colombia.Objective: To study intraspecific variability in different populations of Radopholus similis. Scope: Populations of R. similis mainly from the Bajo Occident of Caldas, Colombia. Methodology: Nineteen morphometric and allometric characters were measured in females and males of R. similis collected in the municipalities of Anserma, Belalcázar, Carepa and Palestina, which were analyzed by principal components and hierarchical clustering. The partial region ITS1-5.8S-ITS2 and the 18S ribosomal RNA gene corresponding to the aforementioned R. similis populations were also amplified by PCR and sequenced. With these sequences, and 61 additional sequences obtained from the NCBI database, a haplotypic network was constructed to detect genetic variation in the species. Main results: Morphometric characterization showed that R. similis females from Anserma and Belalcázar presented a more elongated esophagus and those collected from Palestina were more robust in the anterior region at the level of the stipe base, with more elongated bodies and esophagi. Molecular analysis of the ITS1-5.8S-ITS2 region of ribosomal RNA showed no intraspecific variability among the R. similis populations studied. However, the haplotypic network constructed in this study, together with that collected from the NCBI database, revealed intraspecific variability among R. similis populations from Africa and Southeast Asia. Conclusions: It was not possible to detect molecular variability among the R. similis populations studied. However, morphometric variability was found among R. similis populations from Anserma, Belalcázar, Carepa and Palestina, Colombia.Boletín Científico2023-07-01T00:00:00Z2025-10-08T21:06:33Z2023-07-01T00:00:00Z2025-10-08T21:06:33Z2023-07-01Artículo de revistahttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501Textinfo:eu-repo/semantics/articleJournal articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1application/pdf0123-3068https://repositorio.ucaldas.edu.co/handle/ucaldas/2348510.17151/bccm.2023.27.2.62462-8190https://doi.org/10.17151/bccm.2023.27.2.6https://revistasojs.ucaldas.edu.co/index.php/boletincientifico/article/view/8668spa11629727Boletín Científico Centro de Museos Museo de Historia NaturalAgronet. (2022). Reporte: Área, Producción y Rendimiento Nacional por Cultivo. Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural.https://www.agronet.gov.co/estadistica/Paginas/home.aspx?cod=1Araya, M. (1995). Efecto depresivo de ataques de Radopholus similis en banano (Musa AAA). Corbana, 20(43), 3-6.Arboleda, F., Guzmán, A. y Mejía, L. (2012). Efecto de extractos cetónicos de higuerilla sobre el nematodo barrenador en condiciones in vitro. Luna Azul. 35, 28-48.Bird, A. F. y Bird, J. (2012). The structure of nematodes. Academic Press. Castillo-Russi, J., Araya-Vargas, M. y Patiño-Hoyos, L. (2010). Respuesta a la aplicación de nematicida en banano en la zona de Urabá, Colombia. Agronomía Mesoamericana, 21(2), 307-317.Castresana, J. (2000). Selection of conserved blocks from multiple alignments for their use in phylogenetic analysis. Molecular Biology and Evolution, 17(4), 540-552.Cenibanano. (Centro de Investigaciones del Banano). (2018). Informe Cenibanano 2018.CIAT (Centro Internacional de Agricultura Tropical). (2013). 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