Producción del Factor de Crecimiento Epidérmico Humano recombinante en Komagataella pastoris (Pichia pastoris)
La producción de proteínas recombinantes en levaduras se ha vuelto cada vez más frecuente debido a los beneficios que representan, tales como su fácil manipulación, la capacidad para generar modificaciones postraduccionales y la alta viabilidad para el escalado del proceso. Dentro de las proteínas p...
- Autores:
-
López Carvajal, María Camila
Moreno Pino, Juan José
- Tipo de recurso:
- Trabajo de grado de pregrado
- Fecha de publicación:
- 2024
- Institución:
- Universidad ICESI
- Repositorio:
- Repositorio ICESI
- Idioma:
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- OAI Identifier:
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- Acceso en línea:
- https://hdl.handle.net/10906/130354
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- Palabra clave:
- RhEGF
Proteínas recombinantes
ADN recombinante
K. pastoris
Trabajos de grado de Química Farmacéutica
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Recombinant proteins
Recombinant DNA
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La producción de proteínas recombinantes en levaduras se ha vuelto cada vez más frecuente debido a los beneficios que representan, tales como su fácil manipulación, la capacidad para generar modificaciones postraduccionales y la alta viabilidad para el escalado del proceso. Dentro de las proteínas producidas en dicho microorganismo se encuentra n algunas con potencial terapéutico, y otras con aplicaciones cosmétic as . Una de estas es el factor de crecimiento epidérmico humano (hEGF ) , el cual es un polipéptido que se encuentra de forma natural en orina, plaquetas leche y plasma, se conoce que es fundamental en las vías de señalización celular que r egulan la división y la supervivencia celular . Además , se ha demostrado una buena capacidad en la reparación tisular , por lo que , es empleado en estudios para la regeneración de la piel en diversos campos que van desde curación de heridas hasta el tratamiento contra arrugas . E s importante destacar que hoy en día su producción no es lo suficientemente eficiente para la demanda que se tiene y que se espera . A partir de lo anterior , se ha planteado este proyecto , en búsqueda de desarrollar e implementar una metodología para la producción de este factor de manera recombinante mediante el uso de la levadura Komagatella pastoris , generando así conocimiento para diferentes sectores de la economía como lo son el educativo y el industrial. |
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1. Esquirol Caussa , J. & Herrero Vila, E. Un enfoque para el tratamiento de las úlceras de origen vascular: revisión y papel del factor de crecimiento epidérmico. Angiologia 68, 322 – 330 (2016). 2. Zeng, F. & Harris, R. C. Epidermal growth factor, from gene organization to bedside. Semin Cell Dev Biol 0, 2 (2014). 3. Esquirol Caussa, J. & Herrero Vila, E. Epidermal growth factor, innovation and safety. Medicina Clínica (English Edition) 145, 305 – 312 (2015). 4. Verified Market Reports. Global Epidermal Growth Factor EGF Market By Type (Liquid EGF, Powder EGF), By Application (EGF Cream, EGF Lotion), By Geographic Scope And Forecast. https://www.verifiedmarketreports.com/product/epidermal - growth - factor - egf - market/ (2024). 5. Stefonek - Puccinelli, T. J. & Masters, K. S. Co - immobilization of gradient - patterned growth factors for directed cell migration. Ann Biomed Eng 36, 2121 – 2133 (2008). 6. Tamama, K., Kawasaki, H. & Wells, A. Epidermal Growth Factor (EGF) Treatment on Multipotential Stromal Cells (MSCs). Possible Enhancement of Therapeutic Potential of MSC. J Biomed Biotechnol 2010 , (2010). 7. Shin, S. H., Koh, Y. G., Lee, W. G., Seok, J. & Park, K. Y. The use of epidermal growth factor in dermatological practice. Int Wound J 20 , 2414 – 2423 (2023). 8. Parsons, J. et al. Production of Human Epidermal Growth Factor (hEGF) by in Vitro Cultures of Nicotiana tabacum: Effect of Tissue Differentiation and Sodium Nitroprusside Addition. International Journal of Biotechnology and Biochemistry 6, 131 – 138 (2010). 9. Negahdari, B., Shahosseini, Z. & Baniasadi, V. Production of human epidermal growth factor using adenoviral based system. Res Pharm Sci 11, 43 (2016). 10. Ma, Y. et al. High Efficient Expression, Purification, and Functional Characterization of Native Human Epidermal Growth Factor in Escherichia coli. Biomed Res Int 2016, (2016). 11. Rosano, G. L. & Ceccarelli, E. A. Recombinant protein expression in Escherichia coli: Advances and challenges. Front Microbiol 5, 79503 (2014). 12. Gao, M. & Shi, Z. Process Control and Optimization for Heterologous Protein Production by Methylotrophic Pichia pastoris. Chin J Chem Eng 21, 216 – 226 (2013). 13. Eissazadeh, S. et al. Production of recombinant human epidermal growth factor in Pichia pastoris. Brazilian Journal of Microbiology 48, 286 (2017). 14. Cinza, A. M. et al. Cultivo discontinuo para produccion de hEGF en levaduras. Establecimiento de un cultivo discontinuo para la producción del factor de crecimiento epidérmico humano en levaduras. Caracterización del producto vol. 8 Preprint at (1991). 15. Pina, A. S., Lowe, C. R. & Roque, A. C. A. Challenges and opportunities in the purification of recombinant tagged proteins. Biotechnology Advances vol. 32 366 – 381 Preprint at https://doi.org/10.1016/j.biotechadv.2013.12.001 (2014). 16. Macauley - Patrick, S., Fazenda, M. L., McNeil, B. & Harvey, L. M. Heterologous protein production using the Pichia pastoris expression system. Yeast vol. 22 249 – 270 Preprint at https://doi.org/10.1002/yea.1208 (2005). 17. Eissazadeh, S. et al. Production of recombinant human epidermal growth factor in Pichia pastoris. Brazilian Journal of Microbiology 48, 286 – 293 (2017). 18. Terpe , K. Overview of tag protein fusions: from molecular and biochemical fundamentals to commercial systems. Appl Microbiol Biotechnol 60, 523 – 533 (2003). 19. Ogiso, H. et al. Crystal Structure of the Complex of Human Epidermal Growth Factor and Receptor Extracellular Domains. Cell 110, 775 – 787 (2002). 20. Lu, H. - S. et al. Crystal Structure of Human Epidermal Growth Factor and Its Dimerization . J. Biol. Chem. 276, 34913 – 34917 (2001). 21. Yang, M. et al. Role of N - linked glycosylation in the secretion and enzymatic properties of Rhizopus chinensis lipase expressed in Pichia pastoris. Microb Cell Fact 14, 1 – 14 (2015). 22. Santoso, A., Herawati, N. & Rubiana, Y. Effect of Methanol Induction and Incubation Time on Expression of Human Erythropoietin in Methylotropic Yeast Pichia Pastoris. Makara Journal of Technology 16, 5 (2012). 23. Barrera, Q. B. P. CONSTRUCCION DE UNA CEPA DE Pichia pastoris SOBREPRODUCTORA DE LA ISOFORMA DE 20 kDa DE LA HORMONA DEL CRECIMIENTO HUMANO. (Universidad Autónoma de Nuevo León, 2000). 24. Tutrina, A. & Zhurilov, P. Efficacy assessment of different cryoprotectants for preserving the viability of Enterobacterales strains at − 20 °C. Scientific Reports 2024 14:1 14, 1 – 12 (2024). 25. Nakamura, Y. et al. A stable, autonomously replicating plasmid vector containing Pichia pastoris centromeric DNA. Appl Environ Microbiol 84, (2018). 26. Baumann, K. et al. The impact of oxygen on the transcriptome of recombinant S. cerevisiae and P. pastoris - a comparative analysis. BMC Genomics 12, 218 (2011). 27. Baffled VS Standard Erlenmeyer Flasks. https://www.fdcell.com/productstags/baffled - vs - standard - erlenmeyer - flasks.html 28. Joseph, J. A., Akkermans, S. & Van Impe, J. F. M. Effects of Temperature and pH on Recombinant Thaumatin II Production by Pichia pastoris. Foods 11, 1438 (2022). |
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Una de estas es el factor de crecimiento epidérmico humano (hEGF ) , el cual es un polipéptido que se encuentra de forma natural en orina, plaquetas leche y plasma, se conoce que es fundamental en las vías de señalización celular que r egulan la división y la supervivencia celular . Además , se ha demostrado una buena capacidad en la reparación tisular , por lo que , es empleado en estudios para la regeneración de la piel en diversos campos que van desde curación de heridas hasta el tratamiento contra arrugas . E s importante destacar que hoy en día su producción no es lo suficientemente eficiente para la demanda que se tiene y que se espera . A partir de lo anterior , se ha planteado este proyecto , en búsqueda de desarrollar e implementar una metodología para la producción de este factor de manera recombinante mediante el uso de la levadura Komagatella pastoris , generando así conocimiento para diferentes sectores de la economía como lo son el educativo y el industrial.The production of recombinant proteins in yeasts has become increasingly frequent due to the benefits they represent, such as easy manipulation, the ability to generate post-translational modifications, and high viability for process scaling. Among the proteins produced in this microorganism are some with therapeutic potential, and others with cosmetic applications. One of these is the human epidermal growth factor (hEGF), which is a polypeptide found naturally in urine, platelets, milk, and plasma. It is known to be fundamental in the cellular signaling pathways that regulate cell division and survival. Furthermore, it has demonstrated good capacity in tissue repair, which is why it is used in studies for skin regeneration in various fields ranging from wound healing to wrinkle treatment. It is important to note that today its production is not efficient enough for the current and expected demand. Based on the above, this project has been proposed, seeking to develop and implement a methodology for the recombinant production of this factor using the yeast Komagatella pastoris, thus generating knowledge for different economic sectors such as education and industry.1. Resumen . . . . . 5 -- 2. Introducción . . . . 5 -- 3. Metodología . . . . 7 -- 3.1. Establecimiento de las condiciones de crecimiento de Komagataella pastoris. . 7 -- 3.2. Establecimiento de las condiciones de crecimiento de Komagataella pastoris. . 8 -- 3.3. Determinación de las condiciones para la expresión del rhEGF . . 9 -- 3.3.1. Determinación del tiempo de inducción . . . 9 -- 3.3.2. Determinación de la concentración de metanol . . 9 -- 3.4. Verificación de expresión mediante SDS - PAGE y Western Blot . 10 -- 3.4.1. Tinción con plata . . . . 11 -- 3.5. Cuantificación de proteína por método de Bradford . . 11 -- 3.6. Concentración de la proteína rhEGF . . . 12 -- 4. Resultados y discusión . . . . 12 -- 4.1. Analisis por PCR del transgén de hEGF. . . . 12 -- 4.2. Determinación de las condiciones de expresión . . 13 -- 4.3. Verificación de la expresión de la proteína modificando la concentración del inductor . . . . . 17 -- 5. Conclusiones . . . . 22 -- 6. Agradecimientos . . . . 22 -- 7. Referencias . . . . 22Trabajo de Grado para obtener el título del Programa de Química FarmacéuticaProfesional24 páginasDigitalapplication/pdfspaUniversidad IcesiBarberi de Ingeniería, Diseño y Ciencias AplicadasQuímica FarmacéuticaSantiago de caliEL AUTOR, expresa que la obra objeto de la presente autorización es original y la elaboró sin quebrantar ni suplantar los derechos de autor de terceros, y de tal forma, la obra es de su exclusiva autoría y tiene la titularidad sobre éste. PARÁGRAFO: en caso de queja o acción por parte de un tercero referente a los derechos de autor sobre el artículo, folleto o libro en cuestión, EL AUTOR, asumirá la responsabilidad total, y saldrá en defensa de los derechos aquí autorizados; para todos los efectos, la Universidad Icesi actúa como un tercero de buena fe. Esta autorización, permite a la Universidad Icesi, de forma indefinida, para que en los términos establecidos en la Ley 23 de 1982, la Ley 44 de 1993, leyes y jurisprudencia vigente al respecto, haga publicación de este con fines educativos Todo persona que consulte ya sea la biblioteca o en medio electróico podrá copiar apartes del texto citando siempre la fuentes, es decir el título del trabajo y el autohttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internationalhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Producción del Factor de Crecimiento Epidérmico Humano recombinante en Komagataella pastoris (Pichia pastoris)bachelor thesishttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fTrabajo de gradoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85info:eu-repo/semantics/bachelorThesisTodo PúblicoRhEGFProteínas recombinantesADN recombinanteK. pastorisTrabajos de grado de Química FarmacéuticaRhEGFRecombinant proteinsRecombinant DNAK. pastoris1. Esquirol Caussa , J. & Herrero Vila, E. Un enfoque para el tratamiento de las úlceras de origen vascular: revisión y papel del factor de crecimiento epidérmico. Angiologia 68, 322 – 330 (2016).2. Zeng, F. & Harris, R. C. Epidermal growth factor, from gene organization to bedside. Semin Cell Dev Biol 0, 2 (2014).3. Esquirol Caussa, J. & Herrero Vila, E. Epidermal growth factor, innovation and safety. Medicina Clínica (English Edition) 145, 305 – 312 (2015).4. Verified Market Reports. Global Epidermal Growth Factor EGF Market By Type (Liquid EGF, Powder EGF), By Application (EGF Cream, EGF Lotion), By Geographic Scope And Forecast. https://www.verifiedmarketreports.com/product/epidermal - growth - factor - egf - market/ (2024).5. Stefonek - Puccinelli, T. J. & Masters, K. S. Co - immobilization of gradient - patterned growth factors for directed cell migration. Ann Biomed Eng 36, 2121 – 2133 (2008).6. Tamama, K., Kawasaki, H. & Wells, A. Epidermal Growth Factor (EGF) Treatment on Multipotential Stromal Cells (MSCs). Possible Enhancement of Therapeutic Potential of MSC. J Biomed Biotechnol 2010 , (2010).7. Shin, S. H., Koh, Y. G., Lee, W. G., Seok, J. & Park, K. Y. The use of epidermal growth factor in dermatological practice. Int Wound J 20 , 2414 – 2423 (2023).8. Parsons, J. et al. Production of Human Epidermal Growth Factor (hEGF) by in Vitro Cultures of Nicotiana tabacum: Effect of Tissue Differentiation and Sodium Nitroprusside Addition. International Journal of Biotechnology and Biochemistry 6, 131 – 138 (2010).9. Negahdari, B., Shahosseini, Z. & Baniasadi, V. Production of human epidermal growth factor using adenoviral based system. Res Pharm Sci 11, 43 (2016).10. Ma, Y. et al. High Efficient Expression, Purification, and Functional Characterization of Native Human Epidermal Growth Factor in Escherichia coli. Biomed Res Int 2016, (2016).11. Rosano, G. L. & Ceccarelli, E. A. Recombinant protein expression in Escherichia coli: Advances and challenges. Front Microbiol 5, 79503 (2014).12. Gao, M. & Shi, Z. Process Control and Optimization for Heterologous Protein Production by Methylotrophic Pichia pastoris. Chin J Chem Eng 21, 216 – 226 (2013).13. Eissazadeh, S. et al. Production of recombinant human epidermal growth factor in Pichia pastoris. Brazilian Journal of Microbiology 48, 286 (2017).14. Cinza, A. M. et al. Cultivo discontinuo para produccion de hEGF en levaduras. Establecimiento de un cultivo discontinuo para la producción del factor de crecimiento epidérmico humano en levaduras. Caracterización del producto vol. 8 Preprint at (1991).15. Pina, A. S., Lowe, C. R. & Roque, A. C. A. Challenges and opportunities in the purification of recombinant tagged proteins. Biotechnology Advances vol. 32 366 – 381 Preprint at https://doi.org/10.1016/j.biotechadv.2013.12.001 (2014).16. Macauley - Patrick, S., Fazenda, M. L., McNeil, B. & Harvey, L. M. Heterologous protein production using the Pichia pastoris expression system. Yeast vol. 22 249 – 270 Preprint at https://doi.org/10.1002/yea.1208 (2005).17. Eissazadeh, S. et al. Production of recombinant human epidermal growth factor in Pichia pastoris. Brazilian Journal of Microbiology 48, 286 – 293 (2017).18. Terpe , K. Overview of tag protein fusions: from molecular and biochemical fundamentals to commercial systems. Appl Microbiol Biotechnol 60, 523 – 533 (2003).19. Ogiso, H. et al. Crystal Structure of the Complex of Human Epidermal Growth Factor and Receptor Extracellular Domains. Cell 110, 775 – 787 (2002).20. Lu, H. - S. et al. Crystal Structure of Human Epidermal Growth Factor and Its Dimerization . J. Biol. Chem. 276, 34913 – 34917 (2001).21. Yang, M. et al. Role of N - linked glycosylation in the secretion and enzymatic properties of Rhizopus chinensis lipase expressed in Pichia pastoris. Microb Cell Fact 14, 1 – 14 (2015).22. Santoso, A., Herawati, N. & Rubiana, Y. Effect of Methanol Induction and Incubation Time on Expression of Human Erythropoietin in Methylotropic Yeast Pichia Pastoris. Makara Journal of Technology 16, 5 (2012).23. Barrera, Q. B. P. CONSTRUCCION DE UNA CEPA DE Pichia pastoris SOBREPRODUCTORA DE LA ISOFORMA DE 20 kDa DE LA HORMONA DEL CRECIMIENTO HUMANO. (Universidad Autónoma de Nuevo León, 2000).24. Tutrina, A. & Zhurilov, P. Efficacy assessment of different cryoprotectants for preserving the viability of Enterobacterales strains at − 20 °C. Scientific Reports 2024 14:1 14, 1 – 12 (2024).25. Nakamura, Y. et al. A stable, autonomously replicating plasmid vector containing Pichia pastoris centromeric DNA. Appl Environ Microbiol 84, (2018).26. Baumann, K. et al. The impact of oxygen on the transcriptome of recombinant S. cerevisiae and P. pastoris - a comparative analysis. BMC Genomics 12, 218 (2011).27. Baffled VS Standard Erlenmeyer Flasks. https://www.fdcell.com/productstags/baffled - vs - standard - erlenmeyer - flasks.html28. Joseph, J. A., Akkermans, S. & Van Impe, J. F. M. Effects of Temperature and pH on Recombinant Thaumatin II Production by Pichia pastoris. 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