Extracción de ADN de muestras no invasivas en Xenarthras, un aporte para su conservación.

Introducción. El Superorden Xenarthra es un grupo de mamíferos neotropicales de gran importancia biológica e histórica; el creciente interés en este grupo ha permitido el desarrollo de trabajos a nivel molecular para resolver problemas relacionados con su biología y ecología. Estos trabajos molecula...

Full description

Autores:
Salazar Moscoso, Yuly Marcela
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2019
Institución:
Universidad CES
Repositorio:
Repositorio Digital - Universidad CES
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.ces.edu.co:10946/5721
Acceso en línea:
https://hdl.handle.net/10946/5721
Palabra clave:
Cantidad
Integridad de ADN
Métodos de extracción
Muestras no invasivas
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description Introducción. El Superorden Xenarthra es un grupo de mamíferos neotropicales de gran importancia biológica e histórica; el creciente interés en este grupo ha permitido el desarrollo de trabajos a nivel molecular para resolver problemas relacionados con su biología y ecología. Estos trabajos moleculares, exigen, en primer lugar, la extracción de ADN de alta calidad que contengan una alta pureza, cantidad e integridad. El objetivo del presente trabajo fue encontrar un método y una muestra que proveyeran un ADN de alta calidad. a través de la extracción con dos métodos (Esferas paramagnéticas y membranas de sílica) en combinación con cinco tipos de muestras: tejido, saliva, sangre, pelo y heces. Métodos. Se obtuvieron muestras de tejido, saliva, sangre, pelo y heces de 29 individuos albergados en la fundación AIUNAU, esto según protocolos ya establecidos con algunas modificaciones según cada caso. Se extrajo el ADN de estas muestras con dos métodos de extracción: Esferas paramagnéticas (Kit PrepFiler) y membranas de sílica (Kit GeneJET), siguiendo los protocolos de los fabricantes, y realizando algunas modificaciones. Posteriormente se cuantificó y midió la pureza del ADN extraído por espectrofotometría, se cualificó la integridad a través de electroforesis en gel de agarosa al 1%. Y, por último, se analizaron los datos obtenidos con el programa R, donde se realizó un ANOVA y una prueba de Tukey (HSD). Resultados. En cuanto a la cantidad y pureza de ADN, la muestra de tejido con el kit de extracción PrepFiler fue quien obtuvo mejores resultados. La muestra menos invasiva con resultados óptimos fue la de saliva con el mismo kit de extracción. La integridad se vio más comprometida con el kit de extracción PrepFiler, mientras que con el kit GeneJET el ADN tuvo mayores pesos moleculares. Las comparaciones entre grupos con la prueba Tukey mostraron diferencias entre las muestras de tejido y sangre, tejido y pelo, y tejido y heces. Discusión y conclusiones. Aunque la muestra de tejido con el kit PrepFiler mostró los resultados más altos en cantidad y pureza, esta no se considera un tipo de muestra adecuada, debido a la gran invasión que representaría la toma de esta para el animal. Por su parte, la muestra de saliva con el kit PrepFiler presentó resultados similares a los de músculo, a los de sangre (que es una muestra muy usada) y a los de pelo (muestra utilizada en trabajos previos con Xenarthras); esto ha permitido concluir que este tipo de muestra es ideal para el trabajo con animales del Superorden Xenarthra, ya que el grado de invasión que representa es mínimo y se causa mucho menor estrés al animal en la toma de esta.
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Se obtuvieron muestras de tejido, saliva, sangre, pelo y heces de 29 individuos albergados en la fundación AIUNAU, esto según protocolos ya establecidos con algunas modificaciones según cada caso. Se extrajo el ADN de estas muestras con dos métodos de extracción: Esferas paramagnéticas (Kit PrepFiler) y membranas de sílica (Kit GeneJET), siguiendo los protocolos de los fabricantes, y realizando algunas modificaciones. Posteriormente se cuantificó y midió la pureza del ADN extraído por espectrofotometría, se cualificó la integridad a través de electroforesis en gel de agarosa al 1%. Y, por último, se analizaron los datos obtenidos con el programa R, donde se realizó un ANOVA y una prueba de Tukey (HSD). Resultados. En cuanto a la cantidad y pureza de ADN, la muestra de tejido con el kit de extracción PrepFiler fue quien obtuvo mejores resultados. La muestra menos invasiva con resultados óptimos fue la de saliva con el mismo kit de extracción. 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